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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2021-10-1 19:44:41 | 只看该作者 Only view this author
tiaotiao 发表于 2021-10-1 12:15
谢谢老师,也就是单点能计算时候,orca的结果就是也能作为计算熵焓自由能三者关系式的数值直接用么,精度相 ...

orca的单点能结合高斯的热化学校正也可以,用orca重新优化结构、做频率计算获得热化学校正也可以。结构优化和频率计算必须用同一个软件,但单点能可以用别的软件。
如果你要研究的体系都像这个体系这么大,那么基组完全可以提高到def2TZVP。不过如果提高到这种triple zeta基组的话(尤其是假如决定单点能改用orca算的话),建议改用orca做优化、频率计算,因为orca的RIJCOSX方法对triple zeta以及更大的基组的计算速度有明显优势。对6-31G** orca的优势不明显,此时用高斯也可以
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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发表于 Post on 2021-10-1 21:04:07 | 只看该作者 Only view this author
感谢老师,请问老师如果高斯使用DFT,和您说的3zeta基组,相比较之下,误差应该是比orca计算的大个2-3kcal/mol?和已经做出的实验需要温度进行大致验证(自由能和熵,焓的换算公式换算),应该这个误差还能接受吧,但是要更佳的并且可以用于文章的数据.还是最好最后再使用orca进行CCSD(T)的计算吧

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发表于 Post on 2021-10-1 21:06:02 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-10-1 19:44
orca的单点能结合高斯的热化学校正也可以,用orca重新优化结构、做频率计算获得热化学校正也可以。结构优 ...

优化,频率计算目前用的6-311G**,高斯计算速度也还可以

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-1 21:30:07 | 只看该作者 Only view this author
tiaotiao 发表于 2021-10-1 19:18
明白了,谢谢老师,那么高斯计算使用CCSD(T),在20原子左右才算得比较有效率么

不是“有效率”,而是再大一点都很难算得动。要知道CCSD(T)的标度有多高,不管你用什么程序情况都一样
严格分清楚CCSD(T)和DLPNO-CCSD(T)
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发表于 Post on 2021-10-1 21:31:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-10-1 21:30
不是“有效率”,而是再大一点都很难算得动,要知道CCSD(T)的标度有多高

嗯嗯,知道了

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发表于 Post on 2021-10-1 21:38:42 | 只看该作者 Only view this author
tiaotiao 发表于 2021-10-1 14:04
感谢老师,请问老师如果高斯使用DFT,和您说的3zeta基组,相比较之下,误差应该是比orca计算的大个2-3kcal/mol? ...

对于普通的反应,DFT的平均误差大概比CCSD(T)大3kcal/mol左右。但是个别反应可能大10kcal/mol都有可能,比如涉及自由基阳离子/自由基阴离子的反应,涉及自旋态变化的反应,或者同时形成/断裂很多键的反应。所以建议对于orca能跑得动DLPNO-CCSD(T)的体系,还是用DLPNO-CCSD(T)算一下单点
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-10-1 21:57:05 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-10-1 21:38
对于普通的反应,DFT的平均误差大概比CCSD(T)大3kcal/mol左右。但是个别反应可能大10kcal/mol都有可能, ...

懂了,感谢老师

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发表于 Post on 2021-10-1 22:08:56 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 tiaotiao 于 2021-10-1 22:11 编辑

老师们,请问计算优化频率分析用色散校正,单点能计算时也应该加么?发现加了与没加对比,还是有计算结果差异的,单点能计算也会受色散影响么(以为只有优化,频率分析时候对结构影响大)

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发表于 Post on 2021-10-1 22:36:30 | 只看该作者 Only view this author
tiaotiao 发表于 2021-10-1 15:08
老师们,请问计算优化频率分析用色散校正,单点能计算时也应该加么?发现加了与没加对比,还是有计算结果差异的 ...

需要加,色散校正不仅影响结构、频率,也影响能量。当然如果算单点的方法本身就考虑了色散作用,就不需要加色散校正了
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-2 09:29:06 | 只看该作者 Only view this author
tiaotiao 发表于 2021-10-1 22:08
老师们,请问计算优化频率分析用色散校正,单点能计算时也应该加么?发现加了与没加对比,还是有计算结果差异的 ...

仔细看下文了解常识
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413http://bbs.keinsci.com/thread-9772-1-1.html
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210
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发表于 Post on 2021-10-2 10:36:11 | 只看该作者 Only view this author

软件下载疑惑

Windows版本的ORCA可以下载、安装动态版本的吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-2 11:10:45 | 只看该作者 Only view this author
古与春分 发表于 2021-10-2 10:36
Windows版本的ORCA可以下载、安装动态版本的吗

倘若能下载,自然会在官方下载页面看到,没有自然就是下载不了
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发表于 Post on 2021-10-2 11:32:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-10-2 11:10
倘若能下载,自然会在官方下载页面看到,没有自然就是下载不了

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2021-10-2 20:05:32 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-10-1 22:36
需要加,色散校正不仅影响结构、频率,也影响能量。当然如果算单点的方法本身就考虑了色散作用,就不需要 ...

谢谢老师指导

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发表于 Post on 2021-10-2 20:05:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-10-2 09:29
仔细看下文了解常识
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413(http://bbs ...

谢谢老师

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