计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

61

帖子

0

威望

295

eV
积分
356

Level 3 能力者

1411#
发表于 Post on 2016-5-26 09:28:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-5-25 18:07
是BSSE不是BESS

不要在优化时候用counterpoise,这仅在最后算相互作用能的时候采用

老师好!按老师说的M062X/6-311g(d,p)进行优化之后,计算相互作用能M062X/6-311g(d,p) counterpoise=2 还是L101错误是什么原因呢,谢谢老师!

67

帖子

0

威望

1265

eV
积分
1332

Level 4 (黑子)

1412#
发表于 Post on 2016-5-26 10:29:02 | 只看该作者 Only view this author

请问下B97D3泛函是纯的还是杂化的?

本帖最后由 cym 于 2016-5-26 10:49 编辑

老师,请问下B97D3泛函是纯的还是杂化的?

我觉得应该是纯的吧,加3是色散校正吧?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

1413#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-5-26 16:47:58 | 只看该作者 Only view this author
fzmn 发表于 2016-5-26 09:28
老师好!按老师说的M062X/6-311g(d,p)进行优化之后,计算相互作用能M062X/6-311g(d,p) counterpoise=2 还 ...

看具体错误提示,不要问Lxxx怎么解决,如果说不清楚就把输出文件压缩后上传
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

1414#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-5-26 16:58:17 | 只看该作者 Only view this author
cym 发表于 2016-5-26 10:29
老师,请问下B97D3泛函是纯的还是杂化的?

我觉得应该是纯的吧,加3是色散校正吧?

是纯泛函

PS:讨论、咨询贴不要发到资源分享区
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

586

帖子

0

威望

4192

eV
积分
4778

Level 6 (一方通行)

1415#
发表于 Post on 2016-5-26 20:36:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-5-25 18:12
单点是单点,默认就是单点任务
你干嘛要优化结构?整个体系用PM7或PM6-D3H4半经验一优化完事,很快。这 ...

PM6-D3H4这是什么?

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17221

Level 6 (一方通行)

1416#
发表于 Post on 2016-5-26 20:54:28 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-5-26 20:36
PM6-D3H4这是什么?

一种MOPAC支持的半经验方法。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

1417#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-5-26 23:55:36 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-5-26 20:36
PM6-D3H4这是什么?

先把大体系弱相互作用那篇博文仔细读完,这些在文中都说了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

586

帖子

0

威望

4192

eV
积分
4778

Level 6 (一方通行)

1418#
发表于 Post on 2016-5-27 08:28:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-5-26 23:55
先把大体系弱相互作用那篇博文仔细读完,这些在文中都说了

恩,我读了博文,大概明白了什么意思。

586

帖子

0

威望

4192

eV
积分
4778

Level 6 (一方通行)

1419#
发表于 Post on 2016-5-27 09:09:17 | 只看该作者 Only view this author

PM6计算输入文件

这是我用PM6计算的输入文件,以前没用过,帮忙看看这个输入文件有没有问题?谢谢!

2-4-ts1.gjf

11.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

2494

帖子

11

威望

7054

eV
积分
9768

Level 6 (一方通行)

1420#
发表于 Post on 2016-5-27 09:18:19 | 只看该作者 Only view this author
#p opt=(calcfc,ts,maxcycle=500,noeigentest,tight) freq(noraman) pm6 maxdisk=80GB iop(1/8=10) scf=maxcycle=500 这么丑陋的关键词,你得有多恨高斯

586

帖子

0

威望

4192

eV
积分
4778

Level 6 (一方通行)

1421#
发表于 Post on 2016-5-27 09:43:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-5-25 15:42
能用PM6,此时不用指定原子电荷。
用UFF时你不指定电荷的话就等于原子电荷都为0,根本没法描述low层对 ...

3-21G*这个基组每个数字及字母、符号都是代表什么意思?链接可以发给我看看,尤其是这个*是什么意思?

586

帖子

0

威望

4192

eV
积分
4778

Level 6 (一方通行)

1422#
发表于 Post on 2016-5-27 12:46:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-5-25 15:42
能用PM6,此时不用指定原子电荷。
用UFF时你不指定电荷的话就等于原子电荷都为0,根本没法描述low层对 ...

我用PM6优化全部结构是老是出现l103错误,怎么办?

4

帖子

0

威望

65

eV
积分
69

Level 2 能力者

1423#
发表于 Post on 2016-5-27 13:51:45 | 只看该作者 Only view this author

windows版Gaussian09中M06-2X的使用

计算分子的三重激发态,用B3LYP会严重低估激发能,换用M062X应该较好。
请教一下,Windows版Gaussian怎么选用M062X,没有找到这个选项,谢谢!

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17221

Level 6 (一方通行)

1424#
发表于 Post on 2016-5-27 13:56:56 | 只看该作者 Only view this author
你是问Windows版GaussView里怎么选么?GaussView的泛函不全。如果十分抗拒脱离GaussView,可以按照下图输入,选择No Method,自己填入M062X:


以及应尽早脱离用GaussView点出关键词来,尝试自己写输入。

4

帖子

0

威望

65

eV
积分
69

Level 2 能力者

1425#
发表于 Post on 2016-5-27 14:15:36 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-5-27 13:56
你是问Windows版GaussView里怎么选么?GaussView的泛函不全。如果十分抗拒脱离GaussView,可以按照下图输入 ...

多谢解答!
我会自行学习自己输入的方法!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-24 07:37 , Processed in 0.240230 second(s), 28 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list