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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2016-5-27 15:38:04 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-5-27 13:56
你是问Windows版GaussView里怎么选么?GaussView的泛函不全。如果十分抗拒脱离GaussView,可以按照下图输入 ...

,不知道你还记得不,第二届sob老师的培训吧,最后一天,我坐在你的右边,
https://www.x-mol.com/groups/fan_jianzhong

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-5-27 15:59:16 | 只看该作者 Only view this author
Lune 发表于 2016-5-27 13:51
计算分子的三重激发态,用B3LYP会严重低估激发能,换用M062X应该较好。
请教一下,Windows版Gaussian怎么 ...


写成M062X。
如果你参加过培训班,讲义上介绍Gaussian那部分很明确地说了怎么输入各种泛函,讲义一定要至少完整从头到尾看两遍。讲义上对所有常用关键词都有介绍,比手册里写得明白得多,例子也给了一大堆,完全不需要用gview来生成输入文件。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-5-27 16:03:36 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-5-27 12:46
我用PM6优化全部结构是老是出现l103错误,怎么办?


看具体报错提示,说不清楚就压缩输出文件后上传。不要老问lxxx怎么办,这是很菜鸟的提问方式
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-5-27 16:05:11 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-5-27 09:43
3-21G*这个基组每个数字及字母、符号都是代表什么意思?链接可以发给我看看,尤其是这个*是什么意思?

3-21G*的*是第三周期加极化
不了解这些基组基础的话看这些文章:
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=2190
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-5-27 16:14:59 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-5-27 09:09
这是我用PM6计算的输入文件,以前没用过,帮忙看看这个输入文件有没有问题?谢谢!

去掉一切肮脏、无意义的关键词
#p opt(calcfc,ts,noeigentest) freq pm6
就完了,写那么多乱七八糟的干嘛
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发表于 Post on 2016-5-27 18:39:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-5-27 15:59
写成M062X。
如果你参加过培训班,讲义上介绍Gaussian那部分很明确地说了怎么输入各种泛函,讲义一定 ...

谢谢!
我没参加过培训班,没有讲义,正苦于没有合适的基础教程,能找到的教程往往都跳过了基础问题,以致于刚刚才知道应该脱离GaussView。

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发表于 Post on 2016-5-27 19:45:29 | 只看该作者 Only view this author

用PM6优化过渡态时出现L103错误

第一次用PM6方法优化过渡态,老是出现L103错误,这是输入文件,输出文件不能上传,因为文件太大了,大家帮忙看看这个问题怎么解决,谢谢!

2-4-ts1.1.gjf

13.62 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

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发表于 Post on 2016-5-27 19:55:18 | 只看该作者 Only view this author
.....................
提问方式不对!!!!

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发表于 Post on 2016-5-27 20:39:16 | 只看该作者 Only view this author
这是输入文件

2-4-ts1.2.gjf

11.62 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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发表于 Post on 2016-5-27 20:40:15 | 只看该作者 Only view this author
输出文件没法上传

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发表于 Post on 2016-5-27 20:41:05 | 只看该作者 Only view this author
这是输出文件

2-4-ts1.2.log

2.06 MB, 下载次数 Times of downloads: 3

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-5-27 20:52:44 | 只看该作者 Only view this author

输出文件只要超过1MB,上传之前先压缩,以节省论坛空间

opt里写上cartesian就解决了。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-5-27 20:53:41 | 只看该作者 Only view this author
Lune 发表于 2016-5-27 18:39
谢谢!
我没参加过培训班,没有讲义,正苦于没有合适的基础教程,能找到的教程往往都跳过了基础问题,以 ...

7月中旬预计还有一次科音的量化培训班你可以参加,所有基础知识和计算问题一扫而空。
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发表于 Post on 2016-5-27 20:54:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-5-25 15:42
能用PM6,此时不用指定原子电荷。
用UFF时你不指定电荷的话就等于原子电荷都为0,根本没法描述low层对 ...

针对您说的“换了我肯定直接用PM7优化。进一步如果再用DFT优化提高准确度,对不重要的原子改用3-21G*,重要的用6-31G*。”,然后我在G09里面用PM6进行初始构型的优化,但是优化老出错,我在想是不是可以换用精确度更低的方法?这是输入及输出文件
对于这个错误,我应该怎么解决?

2-4-ts1.2.gjf

11.62 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

2-4-ts1.2.log

2.06 MB, 下载次数 Times of downloads: 0

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发表于 Post on 2016-5-27 21:01:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-5-27 20:52
输出文件只要超过1MB,上传之前先压缩,以节省论坛空间

opt里写上cartesian就解决了。

恩,是直接在opt里的括号里加上这个词吗?cartesian这个词的意思什么?非常感谢您!

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