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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-8 19:30:05 | 只看该作者 Only view this author
欢乐多 发表于 2019-12-8 19:10
老师,您好,在win10系统中,setting.ini与multiwfn程序在同一目录下,但是程序不认可修改的setting.ini文 ...

改完之后重启Multiwfn。并且确保刚启动Multiwfn后没有提示未找到settings.ini
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
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发表于 Post on 2019-12-8 22:38:48 | 只看该作者 Only view this author
请问Sob老师,如果RDG(NCI)方法绘制的等值面图可以把结构的氢键区域显示的很明白了,还有必要用IGM作等值面图做个对比再说明一次吗(结构不是很大)。谢谢老师
自己决定自己的DNA

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发表于 Post on 2019-12-9 10:05:55 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lufenghxu 于 2019-12-9 11:04 编辑

老师,多齿配体形成的配位键(例如η3,4.。。。。)如何使用multiwfn说明其存在?

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发表于 Post on 2019-12-11 11:36:26 | 只看该作者 Only view this author
卢老师您好!初入计算化学,如有愚昧之处请多多包涵。
我最近在计算锕系体系,想用Multiwfn计算其VCD。因为有用到赝势和赝势基组,所以关键词为# pbe1pbe genecp freq=VCD,但报错。使用的gjf文件为优化好的log文件重新保存后,修改关键词并加上赝势和赝势基组所得。得到的log文件显示Atomic number out of range in FilAMS.
Error termination via Lnk1e in /opt/soft/g16/l1002.exe
网上也没有搜索到相关原因,所以发帖求助。先谢谢老师!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-15 10:27:04 | 只看该作者 Only view this author
QuantumHan 发表于 2019-12-8 22:38
请问Sob老师,如果RDG(NCI)方法绘制的等值面图可以把结构的氢键区域显示的很明白了,还有必要用IGM作等值面 ...

不用
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-15 10:27:28 | 只看该作者 Only view this author
发量浓密 发表于 2019-12-11 11:36
卢老师您好!初入计算化学,如有愚昧之处请多多包涵。
我最近在计算锕系体系,想用Multiwfn计算其VCD。因 ...

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-15 10:27:54 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2019-12-9 10:05
老师,多齿配体形成的配位键(例如η3,4.。。。。)如何使用multiwfn说明其存在?

算个键级就能说明。从定域化分子轨道角度也能说明
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发表于 Post on 2019-12-16 21:56:22 | 只看该作者 Only view this author
老师,激子耦合计算过大是什么原因呢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-16 23:50:29 | 只看该作者 Only view this author
zj123_45 发表于 2019-12-16 21:56
老师,激子耦合计算过大是什么原因呢

我不晓得你具体怎么算的
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发表于 Post on 2019-12-17 11:04:48 | 只看该作者 Only view this author
使用Gaussian扫描势能面,保存chk文件,其中包含势能面上多个分子的结构,转成fch文件后使用Multiwfn处理,如对势能面上的每个分子结构进行拓扑分析,Multiwfn能不能对fch文件中每个分子结构进行处理?

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发表于 Post on 2019-12-18 15:29:58 | 只看该作者 Only view this author
卢老师您好,再用Multiwfn计算分子表面静电势时,软件提示以下报错信息: Calculating electrostatic potential at surface vertices, please wait patiently
Since the input file type is fch/fchk/chk and "cubegenpath" parameter in settings.ini has been properly defined, now Multiwfn directly invokes cubegen to calculate electrostatic potential
Running: /home/msi/g16/cubegen   28 potential=SCF "/home/msi/new/Multiwfn_3.7_dev_bin_Linux/CT.fchk" ESPresult.cub -5 h < cubegenpt.txt > nouseout
sh: 行 1: 26125 段错误               (吐核)/home/msi/g16/cubegen 28 potential=SCF "/home/msi/new/Multiwfn_3.7_dev_bin_Linux/CT.fchk" ESPresult.cub -5 h < cubegenpt.txt > nouseout
forrtl: severe (24): end-of-file during read, unit 10, file /home/msi/new/Multiwfn_3.7_dev_bin_Linux/ESPresult.cub
我尝试将settings.ini文件中 cubegenpath= "/home/msi/g16/cubegen"的路径删除,程序就可以正常运行了,但是计算速度很慢,请问有什么方法能够解决上述问题吗?期待您的回复,谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-19 18:05:06 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2019-12-17 11:04
使用Gaussian扫描势能面,保存chk文件,其中包含势能面上多个分子的结构,转成fch文件后使用Multiwfn处理, ...

fch里只保存最后一次计算时产生的波函数,而之前的结构虽然也保存,但并不保存其波函数。因此你不得不对那些结构再算一次单点然后分析
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-19 18:28:14 | 只看该作者 Only view this author
ssfm 发表于 2019-12-18 15:29
卢老师您好,再用Multiwfn计算分子表面静电势时,软件提示以下报错信息: Calculating electrostatic poten ...

尝试减少nthreads到比如8、十几之类。还不行的话尝试把GAUSS_MEMDEF环境变量定义为几GB或十几GB再试
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发表于 Post on 2019-12-19 20:35:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-12-19 18:05
fch里只保存最后一次计算时产生的波函数,而之前的结构虽然也保存,但并不保存其波函数。因此你不得不对 ...

谢谢社长!

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发表于 Post on 2019-12-19 21:07:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-12-19 18:28
尝试减少nthreads到比如8、十几之类。还不行的话尝试把GAUSS_MEMDEF环境变量定义为几GB或十几GB再试

谢谢您的耐心回复

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