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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

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发表于 Post on 2021-2-28 11:58:33 | 只看该作者 Only view this author
老师,我要用二阶微扰理论进行了自然键轨道(NBO)分析,我看了sob老师你相关帖子,也下载了VMD和Wultiwfn软件,但是好像还是画不出来,这怎么办呢?我可能是对于具体步骤不清楚。希望老师帮帮忙!
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-2-28 20:06:49 | 只看该作者 Only view this author
wy标点人生 发表于 2021-2-28 11:58
老师,我要用二阶微扰理论进行了自然键轨道(NBO)分析,我看了sob老师你相关帖子,也下载了VMD和Wultiwfn软 ...

该说的步骤这里都说了, 已经极尽详细了,重复不出来说明操作不对,反复仔细阅读
使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道
http://sobereva.com/134

另外,看以下文章也有帮助
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269http://bbs.keinsci.com/thread-462-1-1.html
使用Multiwfn+VMD快速绘制高质量分子轨道等值面图(含视频演示)
http://sobereva.com/447http://bbs.keinsci.com/thread-11122-1-1.html
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发表于 Post on 2021-2-28 21:20:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-2-28 20:06
该说的步骤这里都说了, 已经极尽详细了,重复不出来说明操作不对,反复仔细阅读
使用Multiwfn绘制NBO及 ...

好的,谢谢sob老师,我再去试试!
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发表于 Post on 2021-3-2 11:11:32 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,抱歉我之前发错了板块。关于原子电荷的计算,我想请教您两个问题:

我的研究体系是改性碳材料表面,气体小分子的吸附和分解过程,不涉及金属。之前一直采用的是Mulliken电荷,并基于此分析催化剂表面、以及气体分子分解前后的性质。但最近收到意见,要求采用AIM电荷重新计算一些关键结构;我计算AIM电荷后发现,一些结构中部分原子上的AIM电荷,确实与采用Mulliken电荷时的数值有较大差异。现在需要解释,造成这样情况的原因。由于我之前对AIM电荷不太了解,因此想请问您:
1. AIM电荷与Mulliken电荷在相同体系,部分原子上有明显差异,可能有哪些主要的原因?
2. 在目前的体系中,采用哪种电荷结果更为可信?

麻烦您了,谢谢!
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-3 01:37:07 | 只看该作者 Only view this author
wrtgcn 发表于 2021-3-2 11:11
Sob老师,抱歉我之前发错了板块。关于原子电荷的计算,我想请教您两个问题:

我的研究体系是改性碳材料 ...

AIM电荷非常垃圾,仔细看此文便知:《原子电荷计算方法的对比》http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml

Mulliken电荷虽然也不理想,但多数情况比AIM更有化学意义。

对固体表面问题有的是可以用的选择,比如REPEAT、Hirshfeld-I、CM5等
CP2K算REPEAT电荷最近我的博文里还给了例子
使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件
http://sobereva.com/587http://bbs.keinsci.com/thread-21668-1-1.html

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发表于 Post on 2021-3-8 10:13:21 | 只看该作者 Only view this author
卢老师好,我在使用multiwfn的基于分子力场的能量分解功能时,在定义分子片段的时候出现Error: Unable to find parameter for atom    1 with type ?的报错,请问是什么原因呢?谢谢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-9 04:26:51 | 只看该作者 Only view this author
Q-Chembio-llg 发表于 2021-3-8 10:13
卢老师好,我在使用multiwfn的基于分子力场的能量分解功能时,在定义分子片段的时候出现Error: Unable to f ...

应该是原子类型没写对。搞不清楚的话就把这个分析的各种文件压缩后上传,并贴出所有在Multiwfn里输入的命令
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发表于 Post on 2021-3-11 19:59:21 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,请问使用Gaussian计算了NPA电荷后,能否通过multiwfn分析基于NPA的原子自旋布居呢?
另外,我在相应log文件中,只找到了'Mulliken charges and spin densities',请问是否Gaussian 16计算NPA电荷后,是不会自动输出基于NPA的自旋密度?

谢谢您!
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-12 02:00:12 | 只看该作者 Only view this author
wrtgcn 发表于 2021-3-11 19:59
Sob老师,请问使用Gaussian计算了NPA电荷后,能否通过multiwfn分析基于NPA的原子自旋布居呢?
另外,我在 ...

开壳层的NPA分析直接给你了alpha和beta的布居数,需要自己手动提取并求差

仔细看下文搞清楚自旋密度和自旋布居之间是什么关系
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算
http://sobereva.com/353http://bbs.keinsci.com/thread-4422-1-1.html
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发表于 Post on 2021-3-23 09:33:00 | 只看该作者 Only view this author
卢老师好,最近我想用Multiwfn主功能6里面主功能7,输出各类积分的功能(目前主要用的是基函数重叠积分)。但是有时候指数是三位数的时候,Fortran输出的字母E就没了,其他程序读起来会很麻烦。可以麻烦您把这里的输出格式稍微改一下,保证有这个字母E输出么?谢谢您!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-24 22:04:15 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2021-3-23 09:33
卢老师好,最近我想用Multiwfn主功能6里面主功能7,输出各类积分的功能(目前主要用的是基函数重叠积分)。 ...

刚才已更新官网上的最新版,始终都是三位了。
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发表于 Post on 2021-3-24 22:10:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-24 22:04
刚才已更新官网上的最新版,始终都是三位了。

谢谢老师!您辛苦了!

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发表于 Post on 2021-3-28 16:18:37 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,我想请教一下怎么用Multiwfn提取.gjf文件中的xyz成为.xyz文件

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发表于 Post on 2021-3-28 17:03:56 | 只看该作者 Only view this author
小新 发表于 2021-3-28 16:18
sob老师,我想请教一下怎么用Multiwfn提取.gjf文件中的xyz成为.xyz文件

主功能100子功能2,选项2

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发表于 Post on 2021-3-29 19:09:05 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 劲仔小鱼干 于 2021-3-29 19:10 编辑

sob老师 您好!我在“通过轨道权重福井函数和轨道权重双描述符预测亲核和亲电反应位点”中,下载了您的例子C60.fch文件,按照流程绘制后并没有出现“红球和蓝球分别对应于ρ=0.01 a.u.等值面上轨道权重双描述符的极大点和极小点。 ” 如下图所示,请问这是什么原因呢?

屏幕截图 2021-03-29 190938.jpg (169.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 55)

屏幕截图 2021-03-29 190938.jpg

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