简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

sobereva · 发表于 Post on 2021-3-9 04:26:51

Q-Chembio-llg 发表于 2021-3-8 10:13
卢老师好，我在使用multiwfn的基于分子力场的能量分解功能时，在定义分子片段的时候出现Error: Unable to f ...

应该是原子类型没写对。搞不清楚的话就把这个分析的各种文件压缩后上传，并贴出所有在Multiwfn里输入的命令

wrtgcn · 发表于 Post on 2021-3-11 19:59:21

Sob老师，请问使用Gaussian计算了NPA电荷后，能否通过multiwfn分析基于NPA的原子自旋布居呢？
另外，我在相应log文件中，只找到了'Mulliken charges and spin densities'，请问是否Gaussian 16计算NPA电荷后，是不会自动输出基于NPA的自旋密度？

谢谢您！

sobereva · 发表于 Post on 2021-3-12 02:00:12

wrtgcn 发表于 2021-3-11 19:59
Sob老师，请问使用Gaussian计算了NPA电荷后，能否通过multiwfn分析基于NPA的原子自旋布居呢？
另外，我在 ...

开壳层的NPA分析直接给你了alpha和beta的布居数，需要自己手动提取并求差

仔细看下文搞清楚自旋密度和自旋布居之间是什么关系
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算
http://sobereva.com/353（http://bbs.keinsci.com/thread-4422-1-1.html）

snljty · 发表于 Post on 2021-3-23 09:33:00

卢老师好，最近我想用Multiwfn主功能6里面主功能7，输出各类积分的功能（目前主要用的是基函数重叠积分）。但是有时候指数是三位数的时候，Fortran输出的字母E就没了，其他程序读起来会很麻烦。可以麻烦您把这里的输出格式稍微改一下，保证有这个字母E输出么？谢谢您！

sobereva · 发表于 Post on 2021-3-24 22:04:15

snljty 发表于 2021-3-23 09:33
卢老师好，最近我想用Multiwfn主功能6里面主功能7，输出各类积分的功能（目前主要用的是基函数重叠积分）。 ...

刚才已更新官网上的最新版，始终都是三位了。

snljty · 发表于 Post on 2021-3-24 22:10:54

sobereva 发表于 2021-3-24 22:04
刚才已更新官网上的最新版，始终都是三位了。

谢谢老师！您辛苦了！

小新 · 发表于 Post on 2021-3-28 16:18:37

sob老师，我想请教一下怎么用Multiwfn提取.gjf文件中的xyz成为.xyz文件

snljty · 发表于 Post on 2021-3-28 17:03:56

小新发表于 2021-3-28 16:18
sob老师，我想请教一下怎么用Multiwfn提取.gjf文件中的xyz成为.xyz文件

主功能100子功能2，选项2

劲仔小鱼干 · 发表于 Post on 2021-3-29 19:09:05

本帖最后由劲仔小鱼干于 2021-3-29 19:10 编辑

sob老师您好！我在“通过轨道权重福井函数和轨道权重双描述符预测亲核和亲电反应位点”中，下载了您的例子C60.fch文件，按照流程绘制后并没有出现“红球和蓝球分别对应于ρ=0.01 a.u.等值面上轨道权重双描述符的极大点和极小点。 ” 如下图所示，请问这是什么原因呢？

sobereva · 发表于 Post on 2021-3-30 13:04:43

劲仔小鱼干发表于 2021-3-29 19:09
sob老师您好！我在“通过轨道权重福井函数和轨道权重双描述符预测亲核和亲电反应位点”中，下载了您的例子 ...

怀疑你把原子球半径设得太大，把极值点挡住了

snljty · 发表于 Post on 2021-3-30 18:29:13

想请教一下各位老师，这个乙烯的molden文件为什么无法被Multiwfn载入？这是用xtb的单点计算，附件里面的结构文件，gfn2方法。xTB和Multiwfn这两天刚更新过。谢谢！

inputfile.xyz (344 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0)

molden.input.zip (2.29 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

sobereva · 发表于 Post on 2021-3-30 19:36:50

snljty 发表于 2021-3-30 18:29
想请教一下各位老师，这个乙烯的molden文件为什么无法被Multiwfn载入？这是用xtb的单点计算，附件里面的结 ...

之前有bug
我刚才更新了Multiwfn 3.8(dev)解决了此问题

snljty · 发表于 Post on 2021-3-30 19:37:16

sobereva 发表于 2021-3-30 19:36
之前有bug
我刚才更新了Multiwfn 3.8(dev)解决了此问题

谢谢卢老师！简直神速

劲仔小鱼干 · 发表于 Post on 2021-4-15 10:22:20

请教一下sob老师，我用VMD显示弱相互作用时，按照您的教程在examples中复制了RDGfill.vmd,然后在VMD中输入source RDGfill.vmd 后，显示如下，我该如何把外面的红色和蓝色的一圈去除呢？

sobereva · 发表于 Post on 2021-4-16 09:33:16

劲仔小鱼干发表于 2021-4-15 10:22
请教一下sob老师，我用VMD显示弱相互作用时，按照您的教程在examples中复制了RDGfill.vmd,然后在VMD中输入s ...

你改了RDG_maxrho又忘了改回去所致。
此文里用红字都声明了使用Multiwfn图形化研究弱相互作用
http://sobereva.com/68

先把multiwfn目录下的Settings.ini里的RDG_maxrho设为0.0（注意等号后面要留空格。改这个仅限此节的例子，帮助你由浅入深启发式了解RDG方法的原理，此节例子算完后应把它的数值改回默认值0.05，其原因看了后文就会明白）。然后启动Multiwfn，依次输入：
c:\methanedimer.wfn //输入文件的路径

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