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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

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发表于 Post on 2021-6-12 11:54:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-11 23:03
乙炔三聚过程是个“自主”的、有物理意义的过程。我的博文那段话说的是人为虚假的结构不能用。二者不是同 ...

谢谢卢老师,那比如我对某一个二面角做柔性扫描,对得到的势能曲线上的各个点做RDG等分析,可以么?谢谢您!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-15 18:12:40 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2021-6-12 11:54
谢谢卢老师,那比如我对某一个二面角做柔性扫描,对得到的势能曲线上的各个点做RDG等分析,可以么?谢谢 ...

不好一概而论
其中有显著化学意义的点还是可以做的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-6-15 18:19:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-15 18:12
不好一概而论
其中有显著化学意义的点还是可以做的

了解了,谢谢老师!

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发表于 Post on 2021-6-24 14:56:25 | 只看该作者 Only view this author
请教sob老师 在使用Multiwfn计算IRI的时候使用格点精度算出来的等值面是蓝色 但是我改用格点精度为0.08算得到图是黑色 试了几次都是这样 不知道这个怎么调 向您请教

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-24 16:19:38 | 只看该作者 Only view this author
12342234 发表于 2021-6-24 14:56
请教sob老师 在使用Multiwfn计算IRI的时候使用格点精度算出来的等值面是蓝色 但是我改用格点精度为0.08算得 ...

“使用格点精度算出来”语义不明

没必要用0.08 Bohr那么小,此时格点文件可能会巨大,有可能导致32bit VMD因为内存可用量的限制没法载入,进而没法正常着色。非要用这么小格点间距的话,用64bit VMD再试。注意看载入格点文件时VMD文本窗口中的提示。
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发表于 Post on 2021-6-24 19:12:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-24 16:19
“使用格点精度算出来”语义不明

没必要用0.08 Bohr那么小,此时格点文件可能会巨大,有可能导致32bit ...

好的 谢谢sob老师  我再去试一试   使用“低”格点精度  咋少打了一个字  不好意思

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发表于 Post on 2021-7-5 11:40:47 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我想计算乙酰丙酮钌的分子动力学直径,参照了sobereva.com/503,用Muitiwfn导出的pdb文件好像有问题,用Muitiwfn分析导时会闪退,后来注意到这个pdb文件分子式有问题,不知道是哪里出错了,谢谢。
附件内是输入的fch文件和我导出的pdb文件,Gaussian版本为G09WD01,Muitiwfn版本为3.8_win64,系统为win64 20H2



ru.rar

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-6 07:53:51 | 只看该作者 Only view this author
jingnan2019 发表于 2021-7-5 11:40
老师您好,我想计算乙酰丙酮钌的分子动力学直径,参照了sobereva.com/503,用Muitiwfn导出的pdb文件好像有 ...

没有叫Muitiwfn的程序
Multiwfn 3.8到目前根本没有正式发布过
你导出的vtx.pdb是要载入VMD的,干嘛用Multiwfn打开

一个字一个字再次仔细阅读
使用Multiwfn计算分子的动力学直径
http://sobereva.com/503http://bbs.keinsci.com/thread-14264-1-1.html
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发表于 Post on 2021-7-6 13:55:01 | 只看该作者 Only view this author
卢老师在利用Multiwfn程序计算静电势全局极小点一文里,老师提到的J. Comput. Chem., 39, 488 (2018)文章,这个文章中的公式(2)及其上下文如截图所示
学生对这个公式有点疑惑,这个公式(2)是否指的就是在r=r_c处静电势Hessian矩阵的矩阵元,静电势Hessian矩阵是否可以写成如下形式?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-7 08:46:33 | 只看该作者 Only view this author
阿甘 发表于 2021-7-6 13:55
卢老师在利用Multiwfn程序计算静电势全局极小点一文里,老师提到的J. Comput. Chem., 39, 488 (2018)文章, ...


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发表于 Post on 2021-7-9 13:27:33 | 只看该作者 Only view this author

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发表于 Post on 2021-7-9 13:41:58 | 只看该作者 Only view this author
Multiwfn就可以。
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发表于 Post on 2021-7-9 13:42:57 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2021-7-9 13:41
Multiwfn就可以。

有具体的输入文件嘛,感谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-9 13:56:32 | 只看该作者 Only view this author
yqqcjj 发表于 2021-7-9 13:42
有具体的输入文件嘛,感谢

看Multiwfn手册4.7.1节的例子
http://sobereva.com/multiwfn下载

相关常识看
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452
Multiwfn入门tips
http://sobereva.com/167

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-9 17:14:48 | 只看该作者 Only view this author
yqqcjj 发表于 2021-7-9 13:42
有具体的输入文件嘛,感谢

同一个问题别多次发帖提问
你发的另一个相同问题的帖子我已经删了

记住发帖时候恰当命名标题,避免违反论坛规矩,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html
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