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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-27 22:39:38 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2023-11-27 11:16
各位老师好,下边这句话对吗?the energy gap between HOMO and LUMO, is proportional to chemical hardne ...

HOMO-LUMO gap仅仅是和fundamental gap(等同于电子硬度)有弱相关性,下文说了
正确地认识分子的能隙(gap)、HOMO和LUMO
http://sobereva.com/543http://bbs.keinsci.com/thread-16758-1-1.html

但即便是更严格的电子硬度,跟动力学稳定性也没有绝对的必然联系。仅当没有任何具体前提条件的情况下粗略一说,或者对比的是高度类似的体系,才能拿这个说事
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-11-28 08:53:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-11-27 22:39
HOMO-LUMO gap仅仅是和fundamental gap(等同于电子硬度)有弱相关性,下文说了
正确地认识分子的能隙(g ...

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2023-11-28 11:52:44 | 只看该作者 Only view this author

优化过渡金属配合物体系上去就报错

A-1.log (107.01 KB, 下载次数 Times of downloads: 6) A-1.gjf (8.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 4) 这是我的输入文件和输出文件,这个报错没见过,想让各位大佬帮我看一下

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发表于 Post on 2023-11-28 12:23:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 sai77 于 2023-11-28 12:48 编辑

Gaussian 常见报错及解决方法;新手求助报错时的注意事项
http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html

L301,R6DS8: Unable to choose the S8 parameter
成因:使用 empiricaldispersion=GD3 或 empiricaldispersion=GD3BJ 时程序未存有相应泛函的D3色散校正参数。
解决:(1) 确认在D3或D3BJ中选择的正确,例如米尼苏达系列泛函没有D3-BJ参数,不能用empiricaldispersion=GD3BJ,只能用empiricaldispersion=GD3 (2) 换一个有色散校正的泛函 (3) 自定义色散校正参数(往往来源于较新的文献),可以参考《Gaussian中非内置的理论方法和泛函的用法》(http://sobereva.com/344)一文中2.2节的做法,以及手册中的相应部分 (4) 不用色散校正


PBE0在高斯关键词里写作PBE1PBE

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发表于 Post on 2023-11-28 15:00:56 | 只看该作者 Only view this author
想跟大家求助一下,我用高斯优化一个气相的结构,一直拿不到,结构变形是为什么呢?怎样才能拿到这个结构呢?(相关结构已经上传)

新建文件夹.zip

500.74 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

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发表于 Post on 2023-11-28 20:48:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-11-25 20:17
所以就是Pt连接了C6H10OH以后,活化氢气变得容易了。
可以通过Pt的原子电荷确定哪种化学环境下的Pt更缺 ...

老师 我计算了一下Pt的NPA电荷,结构1是Pt连接C6H10O,Pt的电荷是1.022。结构2是Pt连接C6H10OH,Pt的电荷是0.528。结构1中Pt更缺电子,但是它活化氢气是不容易的,与我预期结果相违背,这是为什么呀

结构.zip

84.95 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-29 00:34:56 | 只看该作者 Only view this author
吴双 发表于 2023-11-28 15:00
想跟大家求助一下,我用高斯优化一个气相的结构,一直拿不到,结构变形是为什么呢?怎样才能拿到这个结构呢 ...

此体系在气相下本来就没法维持这种初始结构。如果是从晶体中抠出来的,不要指望气相下能自发维持得住

而且负电荷那么多,用6-31G**根本不行
Lanl2DZ也太烂
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发表于 Post on 2023-11-30 18:00:36 | 只看该作者 Only view this author

做过渡态报错

A02.gjf (3.36 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)
A02.zip (633.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)
这是我的输入和输出文件,这个报错没见过,在贴子里也没查询到,想问下各位大佬这是什么原因呢

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发表于 Post on 2023-11-30 18:40:31 | 只看该作者 Only view this author
请教一下各位老师,我想对这个离子的二面角进行柔性搜索,计算完成后并无报错,但是输出文件打开后只有优化的过程,没有scan的过程,请问是怎么回事?输入文件在附件。

ts1_scan.gjf

1.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

我落人中然自在,本是天上逍遥的仙儿

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发表于 Post on 2023-11-30 19:31:09 | 只看该作者 Only view this author
输出文件的39907行提示A13.chk文件不存在

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发表于 Post on 2023-11-30 20:17:27 | 只看该作者 Only view this author
鲁高因 发表于 2023-11-30 18:40
请教一下各位老师,我想对这个离子的二面角进行柔性搜索,计算完成后并无报错,但是输出文件打开后只有优化 ...

语法不对啊,15后面的0.0000删掉
原子1  原子2  原子3  原子4 S  步数  步长

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发表于 Post on 2023-11-30 20:57:44 | 只看该作者 Only view this author
sai77 发表于 2023-11-30 20:17
语法不对啊,15后面的0.0000删掉
原子1  原子2  原子3  原子4 S  步数  步长

好的,谢谢老师,我去试试。
我落人中然自在,本是天上逍遥的仙儿

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发表于 Post on 2023-11-30 22:23:18 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,我计算了一个磷光体系在S1极小值点和T1极小值点的各种能量信息,如下表所示,数字是D3BJ校正过的激发态单点能,括号内是激发能换算成波长的信息。

我的问题是:
1. 虽然S1态极小值点的S1态能量确实比T1极小值点S1态能量更低,符合极小值的定义,但单看激发能则在S1极小值点结构时S1的发射能量反而更高,这个是合理的吗(我的理解是基态势能面的形状和S1态势能面形状差异很大 可能出现这种情况)?
2. 按照重组能的定义,系间窜跃过程的重组能如此计算会非常非常小(<0.0003Eh),代入Marcus方程计算的系间窜跃速率甚至低于10^-5 /s(反向系间窜跃的过程反而有10^5/s),这个和实验观测的完全不符(显然T1态势能面过于平坦了),这个情况该如何研究呢?
谢谢各位老师。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-1 05:20:04 | 只看该作者 Only view this author
鲁高因 发表于 2023-11-30 20:57
好的,谢谢老师,我去试试。

仔细把此文看了
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html

较新版本的Gaussian做柔性扫描时不能在输入文件里直接指定初值
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-1 05:27:07 | 只看该作者 Only view this author
KSeGaSn 发表于 2023-11-30 22:23
各位老师好,我计算了一个磷光体系在S1极小值点和T1极小值点的各种能量信息,如下表所示,数字是D3BJ校正过 ...

1 正常
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