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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2024-3-19 22:39:23 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-3-19 21:51
需要加水。当然吸附过程中材料可能会取代掉若干个水,假如已知会取代掉所有水,那在做弱相互作用分析时可 ...

好的好的,谢谢老师!再请问游离的阳离子需要加几个水是看这方面的文献,或是根据配位数是几就加几个?

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发表于 Post on 2024-3-20 00:16:46 | 只看该作者 Only view this author
WOOOOWOOOO 发表于 2024-3-19 15:39
好的好的,谢谢老师!再请问游离的阳离子需要加几个水是看这方面的文献,或是根据配位数是几就加几个?

如果已知这个阳离子【在水里】的配位数,那就是配位数是几就加几个。
如果不知道配位数,再查研究这个阳离子的水溶液的文献
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2024-3-20 16:23:34 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 KSeGaSn 于 2024-3-21 08:47 编辑

老师们好,请问我如果对LC-PBE泛函参数进行了调整,α+β=0.41,ω=0.17,其他参数都是LC-PBE默认的,那么此时在ORCA里面该函数写成这样的形式是否正确呢?我只能确认这样确实是可以运行的。

LC-PBE
%method
rangesepmu 0.17
rangesepscal 0.41
ACM 0,0.59,1
end

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发表于 Post on 2024-3-21 09:24:48 | 只看该作者 Only view this author

Gaussian优化完成后计算频率问题

一开始对结构进行opt+freq,但是计算过程中终止了,几何优化的四个收敛限制已经达到,显示优化完成。然后我用优化好的结构进行频率计算,但是SCF一直出错,过程中使用了一下SCF=QC,显示说SCF已经收敛,这是为什么呢?

4f51d2b8fbe9fc1cfc6f29f786220b9.png (11.09 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

4f51d2b8fbe9fc1cfc6f29f786220b9.png

13458fa8776786966ce724673023a13.png (29.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)

13458fa8776786966ce724673023a13.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-21 09:31:02 | 只看该作者 Only view this author
RF-China 发表于 2024-3-21 09:24
一开始对结构进行opt+freq,但是计算过程中终止了,几何优化的四个收敛限制已经达到,显示优化完成。然后我 ...

别轻易用scf=qc,怎么解决SCF不收敛看下文
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

不带极化函数的计算通常没意义
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2024-3-21 09:36:05 | 只看该作者 Only view this author

B3LYP-D3(BJ)/6-31G* 怎么计算

本人是量化方面的新手,在做能量优化的时候,想用sob老师推荐的B3LYP-D3(BJ)/6-31G* 做能量优化,在gjf文件里面第二行直接写 #B3LYP-D3(BJ)/6-31G* opt报错了,不知道这个应该怎么写才规范呢?

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发表于 Post on 2024-3-21 09:48:51 | 只看该作者 Only view this author
#B3LYP/6-31G* opt em=GD3

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发表于 Post on 2024-3-21 09:50:45 | 只看该作者 Only view this author
liang666 发表于 2024-3-21 09:48
#B3LYP/6-31G* opt em=GD3

太感谢啦!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-21 09:52:45 | 只看该作者 Only view this author
couragind 发表于 2024-3-21 09:36
本人是量化方面的新手,在做能量优化的时候,想用sob老师推荐的B3LYP-D3(BJ)/6-31G* 做能量优化,在gjf文件 ...

DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-21 09:52:58 | 只看该作者 Only view this author
liang666 发表于 2024-3-21 09:48
#B3LYP/6-31G* opt em=GD3

是em=gd3bj
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发表于 Post on 2024-3-21 11:43:57 | 只看该作者 Only view this author

离子分子结构优化

请问老师,我用gaussian在PBE0-D3,def2svp级别下对这个离子体系(图1)进行优化,收敛后就成了中性体系(图2)。请问有什么方法可以优化出离子构型吗?

1710992499030.png (27.98 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

图2

图2

1710992462679.png (29.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

图1

图1
感谢每位帮助过我的人

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发表于 Post on 2024-3-21 13:15:47 | 只看该作者 Only view this author
你想计算哪种浓度的硫酸溶液?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-21 13:34:56 | 只看该作者 Only view this author
luchen 发表于 2024-3-21 11:43
请问老师,我用gaussian在PBE0-D3,def2svp级别下对这个离子体系(图1)进行优化,收敛后就成了中性体系(图 ...

优化溶液中的离子时必须带上溶剂模型
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发表于 Post on 2024-3-21 15:17:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-21 13:34
优化溶液中的离子时必须带上溶剂模型

请问老师  ,这个通过隐式溶剂可以实现吗,还是必须显式溶剂
感谢每位帮助过我的人

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发表于 Post on 2024-3-21 16:55:59 | 只看该作者 Only view this author
luchen 发表于 2024-3-21 04:43
请问老师,我用gaussian在PBE0-D3,def2svp级别下对这个离子体系(图1)进行优化,收敛后就成了中性体系(图 ...

因为本来就需要很多额外的水分子分别通过氢键稳定H3O+和HSO4-,才能让离子稳定下来。
这就是为什么虽然稀H2SO4是强电解质,但浓H2SO4里大部分H2SO4分子并不电离。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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