计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

  [复制链接 Copy URL]

5

帖子

0

威望

29

eV
积分
34

Level 2 能力者

3481#
发表于 Post on 2024-6-21 08:55:40 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-6-20 18:54
电荷不对吧?你设的电荷是0,有一个二价阳离子,所以阴离子是2-,也就是说Pb是+4价。但是+4价Pb应该分分 ...

好的老师,我电荷设置为-2我再跑一下
试一试,谢谢啦

13

帖子

0

威望

131

eV
积分
144

Level 2 能力者

3482#
发表于 Post on 2024-6-21 13:06:22 | 只看该作者 Only view this author

ORCA的用户手册有哪位大佬能发一下吗

官网上的orca manual点击下载不了

72

帖子

0

威望

1489

eV
积分
1561

Level 5 (御坂)

3483#
发表于 Post on 2024-6-21 14:07:37 | 只看该作者 Only view this author

1

帖子

0

威望

13

eV
积分
14

Level 1 能力者

3484#
发表于 Post on 2024-6-21 15:54:10 | 只看该作者 Only view this author

优化结构不收敛

Convergence criterion not met.  SCF Done:  E(UB3LYP) =  -2034.30705969     A.U. after  129 cycles             NFock=128  Conv=0.20D-04     -V/T= 2.0019  <Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 0.5000 <S**2>= 0.8244 S= 0.5366  <L.S>= 0.000000000000E+00  Anni     
大佬们,这个意思是SCF收敛吗?没有出现L502。

4114

帖子

4

威望

8873

eV
积分
13067

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

3485#
发表于 Post on 2024-6-21 16:02:14 | 只看该作者 Only view this author
(1)不要效仿那些说L502报错的人。该是什么报错,就贴什么什么报错信息,贴的时候注意空格和空行,不要随手一贴、不顾读者阅读方便与否,最好采用截图方式展示,不会有空格错乱和空行缺失。展示报错信息截图时至少展示10行、20行内容,否则容易使读者断章取义。
(2)标题问的是结构优化不收敛,帖子内容问的是SCF不收敛,二者不是一件事,如果有两个不同的问题,应当清楚表达。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

5

帖子

0

威望

29

eV
积分
34

Level 2 能力者

3486#
发表于 Post on 2024-6-21 16:38:49 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-6-20 18:54
电荷不对吧?你设的电荷是0,有一个二价阳离子,所以阴离子是2-,也就是说Pb是+4价。但是+4价Pb应该分分 ...

改完电荷报错和以前一样,还是不收敛。

屏幕截图 2024-06-21 163711.png (15.73 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

改完电荷还是不收敛

改完电荷还是不收敛

1万

帖子

0

威望

9002

eV
积分
20758

Level 6 (一方通行)

3487#
发表于 Post on 2024-6-21 16:45:21 | 只看该作者 Only view this author
tunanya 发表于 2024-6-21 09:38
改完电荷报错和以前一样,还是不收敛。

首先,排队系统提示失败不必然表示SCF收敛失败,也可能是其他问题,必须检查输出文件的输出。
如果确实是SCF不收敛,按http://sobereva.com/61的方法依次尝试,如果毫无遗漏地全试一遍,所有方法都不行,再来问,问的时候详细说明帖子里哪些方法让收敛变好了,哪些方法让收敛变差了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

449

帖子

0

威望

1561

eV
积分
2010

Level 5 (御坂)

3488#
发表于 Post on 2024-6-21 17:16:51 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,我想请教一下MOMAP对于重组能计算的逻辑是什么呢?

MOMAP对 s0—s1 过程做最简单的evc求重组能和拆分,输入文件只需要基态和激发态的.log和.fchk,此时输入文件并不包含基于s0的几何结构做TD计算结果,但MOMAP的输出文件却可以基于“四点法”给出激发和发射两部分的重组能,以及对应的拆分结果。而且速度很快,不到一分钟。

这是怎么做这么短的时间里,得到输入文件中并未提供的,“四点法”所需要的“第二点”的单点能的呢?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120179

管理员

公社社长

3489#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-22 02:47:04 | 只看该作者 Only view this author
五秒盛夏 发表于 2024-6-21 15:54
Convergence criterion not met.  SCF Done:  E(UB3LYP) =  -2034.30705969     A.U. after  129 cycles    ...

解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61
自己根据量化常识和英文提示理解报错原因
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

449

帖子

0

威望

1561

eV
积分
2010

Level 5 (御坂)

3490#
发表于 Post on 2024-6-23 09:52:09 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好, 请问想计算金属有机配合物可能存在的MLCT发光,可以选用PBE0-D3优化激发态,再用CAM-B3LYP做单点吗(因为我基态是用PBE0-D3优化的)?还是连同基态一起都直接用CAM-B3LYP优化激发态呢?

1万

帖子

0

威望

9002

eV
积分
20758

Level 6 (一方通行)

3491#
发表于 Post on 2024-6-23 15:49:45 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-6-23 02:52
各位老师好, 请问想计算金属有机配合物可能存在的MLCT发光,可以选用PBE0-D3优化激发态,再用CAM-B3LYP做 ...

统一用CAM-B3LYP就行了(但要加色散校正),CAM-B3LYP比PBE0-D3计算量大不了多少,如果你单点用CAM-B3LYP,就说明你认为CAM-B3LYP比PBE0准,那么结构优化没道理不用CAM-B3LYP
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

1万

帖子

0

威望

9002

eV
积分
20758

Level 6 (一方通行)

3492#
发表于 Post on 2024-6-23 15:51:24 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-6-21 10:16
各位老师好,我想请教一下MOMAP对于重组能计算的逻辑是什么呢?

MOMAP对 s0—s1 过程做最简单的evc求重 ...

MOMAP是在谐振近似下得到的重组能。MOMAP虽然不知道S0结构下的S1能量,但是知道S0和S1的结构,S1结构下S1的能量,以及S1结构下S1的Hessian,如果假设势能面是谐振的,就可以计算出S0结构下的S1能量。S1结构下的S0能量同理

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
cokie + 3 谢谢

查看全部评分 View all ratings

Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

449

帖子

0

威望

1561

eV
积分
2010

Level 5 (御坂)

3493#
发表于 Post on 2024-6-23 18:33:31 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-6-23 15:49
统一用CAM-B3LYP就行了(但要加色散校正),CAM-B3LYP比PBE0-D3计算量大不了多少,如果你单点用CAM-B3LYP ...

非常感谢老师的解答!但是对于选用CAM-B3LYP-D3对过渡金属的大共轭有机配体配合物做优化,我有点不太明白的地方还希望老师能解惑:

之前优化选择用PBE0-D3BJ是因为,不少对优化过渡金属的有机配体配合物Benchmark文章,都表示选用PBE0-D3BJ或者TPSSh-D3BJ的表现很好,并且在作对比的同时表示含有较大HF交换成分的泛函在优化时并不普适,所以优化没有选用CAM-B3LYP-D3。

但我又怕PBE0-D3BJ并不能正确描述出荧光辐射过程中的MLCT现象,所以才想用CAM-B3LYP算高精度单点。

请问老师在这样一个前提下,如果我选用CAM-B3LYP-D3来做优化,审稿人提出质疑时,我是否有较好的论据可以支撑我选择CAM-B3LYP-D3优化这个选择呢?

1万

帖子

0

威望

9002

eV
积分
20758

Level 6 (一方通行)

3494#
发表于 Post on 2024-6-23 20:57:10 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-6-23 11:33
非常感谢老师的解答!但是对于选用CAM-B3LYP-D3对过渡金属的大共轭有机配体配合物做优化,我有点不太明白 ...

这种情况下,确实不好抛开具体体系说是CAM-B3LYP-D3好还是PBE0-D3好。可以查一下专门研究MLCT态的benchmark文章。
有CT态的分子,PBE0不一定不适合用,因为CAM-B3LYP虽然能把CT态算准,但可能反倒让LE态更不准(range separated hybrid倾向于高估LE能量)。所以不建议仅因为有CT态就不考虑用PBE0。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
cokie + 3 谢谢

查看全部评分 View all ratings

Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

131

帖子

0

威望

1255

eV
积分
1386

Level 4 (黑子)

3495#
发表于 Post on 2024-6-23 22:44:19 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lurensan 于 2024-6-23 22:52 编辑

各位老师好,请问这种柔性扫描一直升高是什么原因?是反应没有过渡态吗还是扫描的不对。
扫描的13和41的键长

m6-31-s-feng-lianxi sph.7z (226.97 KB, 下载次数 Times of downloads: 2) m-s-feng-lianxi sph-pm7.7z (1.06 MB, 下载次数 Times of downloads: 2)


本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-17 01:23 , Processed in 0.272623 second(s), 30 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list