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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-2 04:02:41 | 只看该作者 Only view this author
ccx 发表于 2022-12-1 21:57
小白,尝试优化两个水分子的结构,为什么会出现这样的问题呢

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

看55L和56L的回复
这种体系opt freq用B3LYP-D3(BJ)比M06-2X是更好的选择,几何优化更容易收敛、出虚频的概率还低,耗时还更低
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
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发表于 Post on 2022-12-2 19:03:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-12-2 04:02
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员 ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2022-12-3 10:23:57 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 奶啵啵 于 2022-12-3 10:52 编辑

请教各位老师一个问题(不好意思,刚才表述不清楚),拿到了一个标准结构以后(文献) ,准备用他做结构优化(PBE0 6-31G(D)),看看能量啥的好往下继续做。可是优化后产生了一定的形变 ,有一个磷酸的位置变得横向了,这。。。。。这不就不标准了,是不是优化后啥样就是啥样了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-3 10:43:49 | 只看该作者 Only view this author
奶啵啵 发表于 2022-12-3 10:23
请教各位老师一个问题,拿到了一个标准结构以后,准备用他做结构优化,看看能量啥的好往下继续做。可是优化 ...

把所有细节交代清楚,仔细看
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html

你当前含糊其辞的提问根本没法回复
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发表于 Post on 2022-12-3 10:53:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-12-3 10:43
把所有细节交代清楚,仔细看
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
ht ...

不好意社长,以后注意,不会再犯,已经重新编辑

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发表于 Post on 2022-12-3 11:33:11 | 只看该作者 Only view this author
请问各位老师,我想把反应物和产物的原子序号进行合理匹配,但是在Edit模块没有找到Connection这个选项,在各帧的显示页面上也没有找到Connection Editor,请问这是怎么回事?谢谢!
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发表于 Post on 2022-12-3 11:58:59 | 只看该作者 Only view this author
Yjc 发表于 2022-12-3 11:33
请问各位老师,我想把反应物和产物的原子序号进行合理匹配,但是在Edit模块没有找到Connection这个选项,在 ...

用GaussView吗?在edit下面有atom list,调整一下就行。
ORCA大法好!算得快,还免费,我爷爷的爷爷都说不赖!
山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔᵊ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ。

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发表于 Post on 2022-12-3 12:19:59 | 只看该作者 Only view this author

Gaussion Linux安装

我安装LInux版本下的gaussion09E版本式,解压后bsd文件中有g09.profile,但是每次开启终端他都显示找不到,我确认配置路径是对的,但是每次一运行就显示没有g09命令行,这是为什么,我是按照sob老师所写步骤安装的,之前安装都没有问题。

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发表于 Post on 2022-12-3 12:35:38 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-12-3 11:58
用GaussView吗?在edit下面有atom list,调整一下就行。

嗯嗯明白了,谢谢老师指点!
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-3 13:54:00 | 只看该作者 Only view this author
秦宁 发表于 2022-12-3 12:19
我安装LInux版本下的gaussion09E版本式,解压后bsd文件中有g09.profile,但是每次开启终端他都显示找不到, ...

把Gaussian默写100遍

提示找不到文件说明就是路径没写对,没有任何其他可能
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发表于 Post on 2022-12-3 21:12:13 | 只看该作者 Only view this author
老师 您好,我想用高斯计算一下四丁基溴化铵和四丁基碘化铵中,C16H36N+与Cl-,C16H36N+与Br-,相互作用的强弱。不太确定这块怎么分析,应该对比他们两者的那个数值呢。
努力做计算的小菜鸡

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-4 01:10:25 | 只看该作者 Only view this author
吴双 发表于 2022-12-3 21:12
老师 您好,我想用高斯计算一下四丁基溴化铵和四丁基碘化铵中,C16H36N+与Cl-,C16H36N+与Br-,相互作用的 ...

结合自由能
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发表于 Post on 2022-12-4 12:58:45 | 只看该作者 Only view this author

关于Dalton关键词求助(X1MNF-SO、.ROOTS...)

刚刚接触Dalton软件,组里没有师哥师姐会这个,我想求助一下各位老师,这几个关键词分别是什么意思,谢谢大家
.PROPRT
X1MNF-SO
.PROPRT
Y1MNF-SO
.PROPRT
Z1MNF-SO
.ROOTS
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-5 02:21:59 | 只看该作者 Only view this author
天天121 发表于 2022-12-4 12:58
刚刚接触Dalton软件,组里没有师哥师姐会这个,我想求助一下各位老师,这几个关键词分别是什么意思,谢谢大 ...

你这种问法别人只能告诉你RTFM
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发表于 Post on 2022-12-5 14:30:27 | 只看该作者 Only view this author
请问计算同一个样品的紫外光谱和荧光光谱的方法需要一致吗?用PBE0计算紫外光谱和实验结果符合的非常好,用同样的方法计算荧光光谱和实验最大波长差了大概60nm,换用PBE38之后与实验相差了大概20nm。不知道是否可以紫外用PBE0算,荧光用PBE38算?还请各位老师指点,谢谢!

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