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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2023-3-2 10:36:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-3-1 15:56
仔细看此文末尾部分
使用Multiwfn超级方便地计算出概念密度泛函理论中定义的各种量
http://sobereva.co ...

好的,谢谢老师的回答!

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发表于 Post on 2023-3-2 10:54:18 | 只看该作者 Only view this author
想问问用原子化的方法,算碳原子的能量,需要矫正从气态到固态的焓差吗,我看thermo in Gaussion 没有涉及到这个

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偽語言學家+註冊摸魚師

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发表于 Post on 2023-3-2 13:23:33 | 只看该作者 Only view this author
davi 发表于 2023-3-2 10:54
想问问用原子化的方法,算碳原子的能量,需要矫正从气态到固态的焓差吗,我看thermo in Gaussion 没有涉及 ...

这个用实验数据就可以了。
ORCA大法好!算得快,还免费,我爷爷的爷爷都说不赖!
山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔᵊ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ。

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发表于 Post on 2023-3-2 18:03:05 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,我在用ORCA计算一个包含C18体系的单点能时出现了报错,输出文件如下,请问应该如何解决呢?

CB2SP.out

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社会浮躁

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发表于 Post on 2023-3-2 20:19:13 | 只看该作者 Only view this author
在分子模拟中,力场中成键项+非键项(范德华项和静电项)
而化学体系中的相互作用分为化学键(共价相互作用+离子键)+弱作用
力场中的成键项应该对应共价相互作用,那非键项的静电项是不是粗略对应于离子键+除了范德华的弱作用?

看了SOB老师的这个http://sobereva.com/413,但由于化学功底不好,还不能完全明白

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发表于 Post on 2023-3-2 23:34:07 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,请问用ORCA计算基态单点能,基态优化过渡态+freq,基态结合能,基态NMR,激发态optfreq,激发态单点能,激发态优化过渡态+freq,激发态结合能,激发态NMR,全都是基于基态optfreq的计算结果来计算的吗?
社会浮躁

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发表于 Post on 2023-3-2 23:54:46 | 只看该作者 Only view this author
cll 发表于 2023-3-2 09:11
请问优化次数,和自洽迭代次数有什么区别嘛,当我比较不同结构键能时,某个结构优化后未收敛,增大优化次 ...

有区别。你修改的只是SCF和结构优化步数的上限值,并且修改上限步数不会影响你所说的可比性。
心之所向,日复一日,必有精进

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-3 06:06:30 | 只看该作者 Only view this author
NGC626 发表于 2023-3-2 23:34
各位老师好,请问用ORCA计算基态单点能,基态优化过渡态+freq,基态结合能,基态NMR,激发态optfreq,激发 ...

“基于基态optfreq的计算结果”语义不确切

诸如“基态优化过渡态+freq”,显然是用合适的过渡态初猜结构(除非你说的是NEB)

诸如“激发态optfreq”,也不严格要求必须用基态极小点当初猜结构
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-3 06:07:57 | 只看该作者 Only view this author
吴双 发表于 2023-3-2 09:46
想跟大家请教一下,我在用高斯做一个醇氧化生成醛的反应,在评估某一步反应的过程中,发现会生成HCl(溶剂 ...

Gaussian里不要用CPM,我反复强调,看此文
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-3 06:09:20 | 只看该作者 Only view this author
NGC626 发表于 2023-3-2 18:03
各位老师好,我在用ORCA计算一个包含C18体系的单点能时出现了报错,输出文件如下,请问应该如何解决呢?

SCF不收敛
按常规解决SCF不收敛的做法解决
首先建议加上notrah关了TRAH,至少对于C18不仅没用还添堵。用KDIIS往往很有益处
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azero 发表于 2023-3-2 20:19
在分子模拟中,力场中成键项+非键项(范德华项和静电项)
而化学体系中的相互作用分为化学键(共价相互作 ...

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davi 发表于 2023-3-2 10:54
想问问用原子化的方法,算碳原子的能量,需要矫正从气态到固态的焓差吗,我看thermo in Gaussion 没有涉及 ...

没有叫Gaussion 的东西,好好看此文
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html
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发表于 Post on 2023-3-3 07:59:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-3-3 06:09
SCF不收敛
按常规解决SCF不收敛的做法解决
首先建议加上notrah关了TRAH,至少对于C18不仅没用还添堵。 ...

老师好,这是我的计算参数,请问应该把notrah加在哪个位置呢?
! wB97X-V def2-QZVPP def2/J RIJCOSX strongSCF noautostart miniprint nopop
%maxcore  1000
%pal nprocs   12 end
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发表于 Post on 2023-3-3 08:02:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-3-3 06:06
“基于基态optfreq的计算结果”语义不确切

诸如“基态优化过渡态+freq”,显然是用合适的过渡态初猜结 ...

不好意思老师,我想表达的是用在基态下做optfreq的最终结构来作为上述几个计算的初猜结构
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发表于 Post on 2023-3-3 08:33:25 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,我想计算包含C18的Interaction energy,请问应该用DLPNO-CCSD(T)/cc-pVTZ with normalPNO and RIJK还是DLPNO-CCSD(T)/cc-pVTZ with tightPNO and RIJK呢?或是用其他计算级别呢?
社会浮躁

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