计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

  [复制链接 Copy URL]

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112374

管理员

公社社长

1336#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-25 23:58:04 | 只看该作者 Only view this author
xiayu1985 发表于 2023-4-25 15:57
各位老师,溶剂化模型适合带电荷体系吗?

计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html

不要随便用“溶剂化”这词,看上文。重新描述当前问题

如果你是指PCM之类隐式溶剂模型是否适合带净电荷的体系,看下文
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html
比SMD算溶解自由能更好的溶剂模型uESE的使用
http://sobereva.com/593http://bbs.keinsci.com/thread-22879-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112374

管理员

公社社长

1337#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-25 23:59:35 | 只看该作者 Only view this author

轻易能在程序主页或手册里找到答案的就没必要问,远比你在论坛上等着别人回复快得多
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

1万

帖子

0

威望

7396

eV
积分
18149

Level 6 (一方通行)

1338#
发表于 Post on 2023-4-26 00:25:48 | 只看该作者 Only view this author
NGC626 发表于 2023-4-25 12:22
各位老师好,请问C1点群的价层占据轨道有哪些呢?

如果你问的是不可约表示的话,C1群下只有一种不可约表示的轨道,A表示。这个和是否价层、是否占据无关
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

106

帖子

0

威望

408

eV
积分
514

Level 4 (黑子)

1339#
发表于 Post on 2023-4-26 10:31:48 | 只看该作者 Only view this author
结构优化和频率算了好久,到了这一步,想问问是不是差不多了,慌了。
算了好久了4天了,真慌。

屏幕截图 2023-04-26 102646.png (10.35 KB, 下载次数 Times of downloads: 23)

屏幕截图 2023-04-26 102646.png

239

帖子

0

威望

756

eV
积分
995

Level 4 (黑子)

1340#
发表于 Post on 2023-4-26 21:30:27 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,我阅读过很多次http://sobereva.com/272 sob老师对于DFT泛函选择的建议,目前我手头上在做的一个分子,同时具有第四周期过渡金属配合物、有金属金属相互作用(有一定成键,且可能会主要研究这个作用)、电荷转移的激发态、同时要考察单重态和三重态能量等因素,因此偏重不同方面可能有MN15L、PBE0、PBE38、TPSSh等选择。实验组的文章对我类似的体系泛函一般都是用B3LYP和PBE0,因此我先选择PBE0进行基态/激发态优化,但不可避免的大大低估了发射能(实验<600nm,计算>750nm),请问各位老师有其他泛函的建议吗?因为分子比较大,做泛函测试比较困难,请多多谅解!

1万

帖子

0

威望

7396

eV
积分
18149

Level 6 (一方通行)

1341#
发表于 Post on 2023-4-27 01:25:54 | 只看该作者 Only view this author
KSeGaSn 发表于 2023-4-26 14:30
各位老师好,我阅读过很多次http://sobereva.com/272 sob老师对于DFT泛函选择的建议,目前我手头上在做的一 ...

600nm和750nm的差别不算太大。可以考虑计算振动分辨光谱,或者打开TDA,或者用更精确的方法处理溶剂效应
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

1万

帖子

0

威望

7396

eV
积分
18149

Level 6 (一方通行)

1342#
发表于 Post on 2023-4-27 01:26:21 | 只看该作者 Only view this author
奶啵啵 发表于 2023-4-26 03:31
结构优化和频率算了好久,到了这一步,想问问是不是差不多了,慌了。
算了好久了4天了,真慌。

要看gradient变化和step。光看能量不够
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112374

管理员

公社社长

1343#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-27 05:37:21 | 只看该作者 Only view this author
奶啵啵 发表于 2023-4-26 10:31
结构优化和频率算了好久,到了这一步,想问问是不是差不多了,慌了。
算了好久了4天了,真慌。

自行看输出文件里的收敛判断标准的当前值和收敛阈值,以及这些值随步数怎么变化
光贴这个能量变化图根本没用
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112374

管理员

公社社长

1344#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-27 05:40:31 | 只看该作者 Only view this author
KSeGaSn 发表于 2023-4-26 21:30
各位老师好,我阅读过很多次http://sobereva.com/272 sob老师对于DFT泛函选择的建议,目前我手头上在做的一 ...

常见误区是把所有误差都归咎于泛函

倘若其它方面都考虑得充分了,觉得误差主要就是来自于泛函,去看发射态的电子激发特征,如果CT特征很显著,尝试改用CAM-B3LYP或PBE38等
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

106

帖子

0

威望

408

eV
积分
514

Level 4 (黑子)

1345#
发表于 Post on 2023-4-27 09:00:01 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-4-27 01:26
要看gradient变化和step。光看能量不够

我瞅瞅

44

帖子

0

威望

232

eV
积分
276

Level 3 能力者

1346#
发表于 Post on 2023-4-27 09:07:37 | 只看该作者 Only view this author
想请教各位老师:gaussian中的casscf mp2联用和caspt2是一样的吗?如果不一样,这两个具体差别是什么呢?gaussian中casscf mp2联用适用于什么情况呢?

249

帖子

0

威望

1254

eV
积分
1503

Level 5 (御坂)

争取学好计算化学!

1347#
发表于 Post on 2023-4-27 11:00:55 | 只看该作者 Only view this author
老师,怎么从键级大小来判断成的什么键呢?我计算了Mayer键级、Wiberg键级、Fuzzy键级,但是,算出来的数怎么知道它们成什么键呢?比如有些算出来是0.803、1.305、0.350。有没有一个具体的判断依据呢?
始终相信生活美好,万物可爱!

239

帖子

0

威望

756

eV
积分
995

Level 4 (黑子)

1348#
发表于 Post on 2023-4-27 14:31:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-27 05:40
常见误区是把所有误差都归咎于泛函

倘若其它方面都考虑得充分了,觉得误差主要就是来自于泛函,去看发 ...

好的,谢谢老师,我其实主要关注的并不是能量信息,还是比较害怕因为泛函不合适导致优化出来的激发态构型定性不正确。

239

帖子

0

威望

756

eV
积分
995

Level 4 (黑子)

1349#
发表于 Post on 2023-4-27 14:33:31 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-4-27 01:25
600nm和750nm的差别不算太大。可以考虑计算振动分辨光谱,或者打开TDA,或者用更精确的方法处理溶剂效应

好的,谢谢老师,宏观上看数值觉得差的比较大(实际上大概差了0.5eV)所以就比较担心被质疑到。

165

帖子

0

威望

836

eV
积分
1001

Level 4 (黑子)

1350#
发表于 Post on 2023-4-27 15:10:32 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-4-26 00:25
如果你问的是不可约表示的话,C1群下只有一种不可约表示的轨道,A表示。这个和是否价层、是否占据无关

嗯嗯,谢谢w老师
社会浮躁

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 21:27 , Processed in 0.234949 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list