分子模拟可视化力场辅助工具AuToFF发布

slxc920113 · 发表于 Post on 2025-5-22 10:14:43

sarphuart 发表于 2025-5-22 09:31
不是为不为零的问题，而是生成的电荷基本都是瞎编，明显不在合理的范围之内，试了三四个200左右的原子都 ...

超过100个原子的体系，不会做结构优化，直接计算电荷，如果你上传的结构本身很离谱，那么半经验方法计算出来的电荷也会很离谱。所以才有专门的聚合物模块，根据单体来计算电荷。

sarphuart · 发表于 Post on 2025-5-23 00:11:29

slxc920113 发表于 2025-5-22 10:14
超过100个原子的体系，不会做结构优化，直接计算电荷，如果你上传的结构本身很离谱，那么半经验方法计算 ...

学到了，谢谢老师

xiaowu759 · 发表于 Post on 2025-5-30 16:59:02

生成的文件中重命名了原子名称，由于原子数较多，名称字符溢出，导致同名，请问如何解决？

xiaowu759 · 发表于 Post on 2025-5-31 18:49:29

xiaowu759 发表于 2025-5-30 16:59
生成的文件中重命名了原子名称，由于原子数较多，名称字符溢出，导致同名，请问如何解决？

能否不重命名，这样才方便核对修改

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