简单量子化学问题答疑专帖（旧版，已关帖）

菜还不想动 · 发表于 Post on 2022-4-22 15:24:50

请问，tpssh泛函和tpsstpss泛函的区别，和tppsh泛函怎么写keyword？

snljty · 发表于 Post on 2022-4-22 15:39:21

本帖最后由 snljty 于 2022-4-22 16:16 编辑

TPSSh在Gaussian就写作TPSSh，TPSS在Gaussian里写作TPSSTPSS，写法自己去http://gaussian.com/dft看即可。前者是个10%HF成分的杂化泛函，后者是纯泛函，具体差别看原位，应用差别看Benchmark和卢老师博文简谈量子化学计算中DFT泛函的选择

菜还不想动 · 发表于 Post on 2022-4-22 16:01:24

snljty 发表于 2022-4-22 15:39
TPSSh在Gaussian就叫TPSSh。TPSS在Gaussian里写作TPSSTPSS。前者是个10%HF成分的杂化泛函，后者是纯泛函， ...

那如果使用tpssh泛函，该怎么调用泛函，写keyword？

sobereva · 发表于 Post on 2022-4-22 20:55:38

菜还不想动发表于 2022-4-22 16:01
那如果使用tpssh泛函，该怎么调用泛函，写keyword？

Gaussian的问题别发到第一性原理版，严重扰乱论坛秩序。这次给你合并了，下次删帖扣分处理
别人回复的明明白白，还在自说自话？第一句话就是答案，阅读理解能力为0么？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-4-22 22:11:25

菜还不想动发表于 2022-4-22 09:01
那如果使用tpssh泛函，该怎么调用泛函，写keyword？

“TPSSh在Gaussian就写作TPSSh”的意思就是，如果使用TPSSh泛函，keyword应该写作TPSSh。
不能别人回答的时候和你问的句式不一样就不认识了。。。

Dolantin · 发表于 Post on 2022-4-24 10:43:56

请教一下各位，我在用shermo程序计算自由能时，shermo程序内需设置ilowfreq，也就是需要在RRHO模型和准RRHO模型做选择，sob老师在此帖http://sobereva.com/552中说到，“算柔性体系的时候应当用两种准RRHO模型中的一种，而算刚性体系的情况，由于没有低频，用准RRHO还是RRHO都可以，结果几乎没区别。” 我应该如何判断自己的计算体系是柔性还是刚性的呢？可否分享一些相关资料

xiaobai1 · 发表于 Post on 2022-4-24 11:09:04

在计算反应能垒的时候可以用低精度的零点能+高精度的电子能来表示吗

chands · 发表于 Post on 2022-4-24 11:21:24

xiaobai1 发表于 2022-4-24 11:09
在计算反应能垒的时候可以用低精度的零点能+高精度的电子能来表示吗

你为什么不顺手算自由能呢？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-4-24 15:20:51

本帖最后由 wzkchem5 于 2022-4-24 10:01 编辑

Dolantin 发表于 2022-4-24 03:43
请教一下各位，我在用shermo程序计算自由能时，shermo程序内需设置ilowfreq，也就是需要在RRHO模型和准RRHO ...

sob老师已经说得很清楚了，如果不能判断，就用准RRHO，因为准RRHO只可能比RRHO好而不可能比RRHO差。
对于判断是否必须用准RRHO这个特定问题而言，唯一需要看的是最低的振动频率（注意振动两个字，也就是要人为排除掉平动和转动），最低的振动频率足够低就是柔性的，否则就是刚性的。但多低算低没有业内统一的标准，一般这个阈值在100~300个波数左右，具体取多少应该需要你调研你们小领域内的文献，看你们小领域一般取多少，不同的小领域的惯例未必相同。此外不同问题里面判断刚性和柔性的标准不尽一致，所以以上标准只适用于判断是否必须用准RRHO，不一定适用于其他场合，例如判断荧光分子的非辐射弛豫是否显著。

Yin · 发表于 Post on 2022-4-24 15:27:59

Sob老师好，我在研究一个激发态分子内电子质子转移的过程，O-H上的H转移到了C=O上的O，从而原来的羰基变成了羟基，原来的羟基变为了羰基。实验是通过激发羰基而实现了质子转移的过程，而不是通过激发羰基。我想问一下老师，我通过计算整个分子的ALIE，找到了极小值的位置就在C=O附近，能否解释实验中激发羰基比激发羟基更容易实现的问题呢？

xiaobai1 · 发表于 Post on 2022-4-24 15:42:28

chands 发表于 2022-4-24 11:21
你为什么不顺手算自由能呢？

那是用低精度自由能和零点能+高精度的电子能来表示当前物质的能量吗？

北大-陶豫 · 发表于 Post on 2022-4-24 15:47:10

xiaobai1 发表于 2022-4-24 15:42
那是用低精度自由能和零点能+高精度的电子能来表示当前物质的能量吗？

算频率的时候，自由能G、焓H这些热力学数据就顺手都算出来了。文献里给的能量一般是G和H。
一般在中等精度下算频率、高精度下算单点能。可以参见：浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组http://sobereva.com/387

snljty · 发表于 Post on 2022-4-24 16:07:45

xiaobai1 发表于 2022-4-24 15:42
那是用低精度自由能和零点能+高精度的电子能来表示当前物质的能量吗？

建议认真阅读卢老师博文使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-4-24 17:02:59

Yin 发表于 2022-4-24 08:27
Sob老师好，我在研究一个激发态分子内电子质子转移的过程，O-H上的H转移到了C=O上的O，从而原来的羰基变成 ...

“实验是通过激发羰基而实现了质子转移的过程，而不是通过激发羰基。”到底是激发的谁

Yin · 发表于 Post on 2022-4-24 19:28:06

wzkchem5 发表于 2022-4-24 17:02
“实验是通过激发羰基而实现了质子转移的过程，而不是通过激发羰基。”到底是激发的谁

不好意思老师，写错了，应该是“实验是通过激发羰基而实现了质子转移的过程，而不是通过激发羟基。”

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Gaussian计算使用泛函问题