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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-5 08:55:14 | 只看该作者 Only view this author
隐式溶剂模型下没法计算溶解焓,只能计算溶解自由能,因此做了近似
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发表于 Post on 2017-7-5 09:34:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-7-5 08:55
隐式溶剂模型下没法计算溶解焓,只能计算溶解自由能,因此做了近似

G = H - TS = E - pV - TS
隐式溶剂模型下△G_solv = E_s - E_g
在隐式溶剂模型下不考虑气、液相0K到298K的平动、转动和振动,所以△G_solv = △E_solv = △H_solv。

是不是可以这么理解。

谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-5 10:01:41 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2017-7-5 09:34
G = H - TS = E - pV - TS
隐式溶剂模型下△G_solv = E_s - E_g
在隐式溶剂模型下不考虑气、液相0K到29 ...


隐式溶剂模型对当前问题算的是溶解自由能,平动、转动、升温造成热力学增量那些是freq的事
溶解焓和溶解自由能相差有限,所以近似视为等价
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发表于 Post on 2017-7-5 10:24:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-7-5 06:43
没听说过eu单位
熵常用单位就是J/mol/K或cal/mol/K,高斯输出文件里直接给的就是后者。

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2017-7-5 10:36:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-7-5 10:01
隐式溶剂模型对当前问题算的是溶解自由能,平动、转动、升温造成热力学增量那些是freq的事
溶解焓和溶 ...

谢谢社长回复!

对于气、液相都优化和频率分析。
从理论上来说△H_solv = H_s - H_g这么计算是不是比用△G_solv代替△H_solv更合理。

谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-5 10:58:33 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2017-7-5 10:36
谢谢社长回复!

对于气、液相都优化和频率分析。


你在隐式溶剂模型下本来就得不到体系的焓值。在溶剂模型下做freq得到的焓不是严格物理意义上的溶剂下的焓。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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sobereva 发表于 2017-7-5 10:58
你在隐式溶剂模型下本来就得不到体系的焓值。在溶剂模型下做freq得到的焓不是严格物理意义上的溶剂下的 ...

明白了。
谢谢!

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发表于 Post on 2017-7-5 11:04:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-7-5 06:39
关键词本身没有问题。test根本不影响结果,所以根本就不应加。Density=Current 也没必要写,除非要分析 ...

收到。谢谢sob的回复。

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发表于 Post on 2017-7-5 11:06:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-7-5 06:43
没听说过eu单位
熵常用单位就是J/mol/K或cal/mol/K,高斯输出文件里直接给的就是后者。

1eu = 1 cal/K/mol

The Journal of Chemical Physics 81, 2016 (1984); doi: 10.1063/1.447824

eu.png (17.16 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

eu.png

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发表于 Post on 2017-7-5 12:56:48 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好!再次的打扰给您带来不便,深感抱歉。想请教一下:高斯中能不能使用LACVP**以及LACV3P**基组,关键词是不是LACVP**或LACV3P**,还是从EMSL网站上考倍基组?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-5 17:04:55 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2017-7-5 12:56
sob老师您好!再次的打扰给您带来不便,深感抱歉。想请教一下:高斯中能不能使用LACVP**以及LACV3P**基组, ...

LACVP这类方式命名的基组的含义
http://sobereva.com/213
需自定义

没事不要用这类基组。
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发表于 Post on 2017-7-5 19:57:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-7-5 17:04
LACVP这类方式命名的基组的含义
http://sobereva.com/213
需自定义

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2017-7-6 08:48:04 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,最近有个问题一直在困扰着我,想请教您一下:
上述过程为经典的芬顿反应,现在想要找H2O2在含Fe催化剂表面分解时的过渡态。即H-O-O-H在中间断键,并得到两个HO基团。我想问您的是:
1.计算得到的生成物如何判断哪个HO基团是HO-,哪个是·OH?二者在Gview里直接看没有区别。
2.反应产物里有带负电的HO-基团,那选择基组的时候是否要考虑弥散呢?
3.计算这个反应过程,有什么需要注意的事项吗?
之前一直是计算分子,刚开始尝试计算反应,理解尚浅,望老师指点。
It's my life and it's now or never

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-6 08:59:54 | 只看该作者 Only view this author
wrtgcn 发表于 2017-7-6 08:48
sob老师,最近有个问题一直在困扰着我,想请教您一下:
上述过程为经典的芬顿反应,现在想要找H2O2在含Fe ...


1 计算原子电荷判断
2 优化、找过渡态时候可以不加弥散,计算整个过程的能量变化、势垒的时候加弥散
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发表于 Post on 2017-7-6 09:05:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-7-6 08:59
1 计算原子电荷判断
2 优化、找过渡态时候可以不加弥散,计算整个过程的能量变化、势垒的时候加弥散

sob老师,您能具体说说如何靠原子电荷判断·OH与HO-吗?我还是没有想通。判断单电子不是应该计算自选布局的吗?
It's my life and it's now or never

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