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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-7-17 15:10:03 | 只看该作者 Only view this author

一个疑惑,M062X和M06-2X有什么差别吗?

本帖最后由 沽宁 于 2017-7-17 15:10 编辑

第一次写问题,我在用Gaussian提交任务的时候,写成M06-2X,出现这样的提醒,

然后我试着改成M062X,最后能够运行,那么这个中间的短线不能被Gaussian识别的原因是什么呢?(初次提问,多多包涵)

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发表于 Post on 2017-7-17 15:14:44 | 只看该作者 Only view this author
因为高斯程序就是这么写的。
关键词按高斯手册写,不要猜着写。都按文献写的话ωB97XD怎么办

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发表于 Post on 2017-7-17 15:28:30 | 只看该作者 Only view this author
基组也是一样的道理吗?前几天用到了def2-TZVPP,也是出错的,最后我尝试改成def2TZVPP,才得以运行。

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发表于 Post on 2017-7-17 16:15:29 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 xuannuo5 于 2017-7-17 16:17 编辑

请教老师,一个简单的SO3分子在M062X/6-311++G(3df,3pd)水平下优化,体系的统一收敛标准是tight,为什么能量这么难收敛呢。试了老师在课件里的所有解决方法都行不通。同样,对于(SO3)2-,(SO4)2- 也出现的同样的问题。
%mem=1000MB                                                                                                                     
%chk=SO3--.chk                                                                                                               
%nproc=4                                                                                                                        
# M062X/6-311++G(3df,3pd)   opt(tight,nolinear) scrf=(cpcm,solvent=water)    freq=noraman  

Title Card Required                                                                                                            

-2  1                                                                                                                           
     16          0        0.000074   -0.000038    0.346745                                                                     
      8           0        1.383558   -0.260272   -0.231195                                                                     
      8           0       -0.917374   -1.067551   -0.231020                                                                     
      8           0       -0.466332    1.327899   -0.231276                                                                     




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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-17 16:23:57 | 只看该作者 Only view this author
沽宁 发表于 2017-7-17 15:28
基组也是一样的道理吗?前几天用到了def2-TZVPP,也是出错的,最后我尝试改成def2TZVPP,才得以运行。


不要随意发挥,能怎么写显然都在手册里,不看手册怎么用程序,程序不能“猜着用”
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-17 16:26:16 | 只看该作者 Only view this author
xuannuo5 发表于 2017-7-17 16:15
请教老师,一个简单的SO3分子在M062X/6-311++G(3df,3pd)水平下优化,体系的统一收敛标准是tight,为什么能 ...


这体系opt用tight毫无意义,nolinear我更是从来没说要加这个
noraman完全多余
CPCM写它作甚,看此文第4条
常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词
http://sobereva.com/33

记得优化前gviewi把结构对称化好,收敛会更容易计算也更快

不知道你说的是什么课件,如果是科音的,参加过培训班的话应该不会犯以上错误才对...
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-17 16:34:40 | 只看该作者 Only view this author
yan505256466 发表于 2017-7-17 10:32
谢谢老师。我试了Manual Displacement调值,并把滑条拉动了0.29来沿着虚频模式略微调整结构,又试了加ver ...


所有能用的方法博文里都说了
还有calcall。verytight没必要用,tight足矣,而且用的时候记得必须提高积分格点精度
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-17 16:47:11 | 只看该作者 Only view this author
安衎然 发表于 2017-7-17 12:42
请问高斯G09 C.01版本计算频率中断后,怎么继续计算?(我用了restart关键词,直接link died了,以下是输入 ...

注意看置顶的新人必读了解本论坛正确的贴图方式。


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发表于 Post on 2017-7-17 18:05:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-7-17 16:34
所有能用的方法博文里都说了
还有calcall。verytight没必要用,tight足矣,而且用的时候记得必须提高 ...

好的,我再试一下,非常感谢老师。

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发表于 Post on 2017-7-17 21:26:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-7-17 16:47
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谢谢老师,我再试下

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发表于 Post on 2017-7-18 19:26:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-7-17 16:47
注意看置顶的新人必读了解本论坛正确的贴图方式。

老师,您好!今天我进行了如下尝试:
输入文件命令:%chk=D2C.chk
%mem=150MW
%rwf=loc1.rwf,loc2.rwf,loc3.rwf,loc4.rwf,loc5.rwf,loc6.rwf,loc7.rwf,loc8.rwf,loc9.rwf
%nprocshared=3
# restart
输出文件错误提示:
******************************************
%chk=D2C.chk
%mem=150MW
%rwf=loc1.rwf,loc2.rwf,loc3.rwf,loc4.rwf,loc5.rwf,loc6.rwf,loc7.rwf,loc8.rwf,loc
9.rwf
Error converting string"            loc2.rwf" to an integer.
Input conversion error in IntKMC.
Error termination via Lnk1e in d:\G09W\l1.exe at Tue Jul 18 17:41:49 2017.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  0.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      0 Int=      0 D2E=      0 Chk=      0 Scr=      0
请问这是什么原因导致的结果呢?如何解决这个问题呢?

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发表于 Post on 2017-7-18 20:53:36 | 只看该作者 Only view this author
请问如图中的guess method的这几个参数设置分别适用于什么情况呢?

guess method.png (398.09 KB, 下载次数 Times of downloads: 20)

guess method.png

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发表于 Post on 2017-7-18 22:52:31 | 只看该作者 Only view this author
某一个结构在用conflex, spartan等软件做构象搜索后,再做结构优化,一些教程写到“在优化基础上可以互相比较合并相同构象”,请问sob老师,这种判断可靠吗?判断两构象相同的标准是什么?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-19 05:33:36 | 只看该作者 Only view this author
qcn 发表于 2017-7-18 22:52
某一个结构在用conflex, spartan等软件做构象搜索后,再做结构优化,一些教程写到“在优化基础上可以互相比 ...

参考
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=577
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-19 05:34:22 | 只看该作者 Only view this author
安衎然 发表于 2017-7-18 20:53
请问如图中的guess method的这几个参数设置分别适用于什么情况呢?

没事不要去动它
不同的初猜对于收敛容易程度有影响,见
解决SCF不收敛问题的方法
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