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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2016-1-31 10:18:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-29 17:07
过渡态不是能量极小点,所以本身就没必要能量必须下降

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2016-1-31 11:42:24 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,您好。我按照《Multiwfn结合VMD绘制AIM拓扑分析图》的方法,用VMD绘制的键径,同一分子有的键径显示为虚线有的显示为实线,旋转分子后虚线实线间还会有变化,请问如何使其都显示为实线?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-31 14:30:45 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2016-1-31 11:42
sob老师,您好。我按照《Multiwfn结合VMD绘制AIM拓扑分析图》的方法,用VMD绘制的键径,同一分子有的键径显 ...

你用file-render里tachyon渲染一下看看效果,或者调调显卡驱动里抗锯齿设定看看能否解决
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2016-1-31 16:08:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-31 14:30
你用file-render里tachyon渲染一下看看效果,或者调调显卡驱动里抗锯齿设定看看能否解决

谢谢sob老师。

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发表于 Post on 2016-2-1 10:48:43 | 只看该作者 Only view this author

求助量子化学入门教材

rt

求助量子化学入门教材。本人主要使用高斯软件9

谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-2-1 11:48:42 | 只看该作者 Only view this author
shenzhou070 发表于 2016-2-1 10:48
rt

求助量子化学入门教材。本人主要使用高斯软件9


建议按照此图顺序阅读,网上都有电子版。
高斯入门推荐exploring那本书,刚出了第3版(目前还没电子版,可以凑合看老点的第二版)。

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-2-1 16:26:21 | 只看该作者 Only view this author

高斯构型优化 结果3个no 结果求助

高斯结果求助,高斯构型优化完成之后 Normal termination of Gaussian 09 atSun Jan 31 23:10:41 2016.但是出现了三个no现在算是构型优化失败吗file:///C:\Users\ILC-ZZL\AppData\Roaming\Tencent\Users\1012203014\QQ\WinTemp\RichOle\4YBNQ)HD1RLPCS{K]%@IX7N.png?
  Item               Value     Threshold Converged?
Maximum Force            0.000864     0.000450     NO
RMS    Force            0.000161     0.000300     YES
Maximum Displacement     0.057431     0.001800     NO
RMS    Displacement     0.019162     0.001200     NO
Predicted change inEnergy=-7.790855D-06
谢谢!附件为优化完成后的文件
file:///C:\Users\ILC-ZZL\AppData\Roaming\Tencent\Users\1012203014\QQ\WinTemp\RichOle\4YBNQ)HD1RLPCS{K]%@IX7N.png


DEP.log

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阴离子

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发表于 Post on 2016-2-1 16:46:53 | 只看该作者 Only view this author
你为什么不看6207行的数据?

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发表于 Post on 2016-2-1 16:56:41 | 只看该作者 Only view this author
plus 发表于 2016-2-1 16:46
你为什么不看6207行的数据?

谢谢楼主,明白了,新手还望多多指教

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发表于 Post on 2016-2-1 20:06:48 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lastzealot 于 2016-2-1 20:14 编辑

sob老师,还记得那天请教您关于NBO分析U-O键成分的事情吗?
这个自然轨道在结果中没有显示,您告诉我看手册,我在输入文件中结构描述后面空一行写下了如下信息
$CHOOSE
BOND S 14 1 END
$END
然后空一行写下基组和赝势。但计算出错,显示为
Unrecognized atomic symbol $CHOOSE
Error termination via Lnk1e in /home/guagua/g09/l301.exe at Mon Feb  1 19:57:07 2016.
Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes  0.8 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      5 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
请问这是怎么回事?
输入文件附在这里,请老师帮个忙。

ODA-1-b-nbo.rar

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-2-1 20:28:23 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2016-2-1 20:06
sob老师,还记得那天请教您关于NBO分析U-O键成分的事情吗?
这个自然轨道在结果中没有显示,您告诉我看手 ...

群里回复过了,不要同时在两个地方问
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-2-1 22:40:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-2-1 20:28
群里回复过了,不要同时在两个地方问

好的,谢谢sob老师。

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面壁者

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发表于 Post on 2016-2-2 10:33:58 | 只看该作者 Only view this author
问一个quick question,在有的文献中能看到将高斯型的基组写成诸如(3s2p)/[2s1p]等等两个括号的形式,这种基组在高斯官网上也没有详细的描述。
请问如何将这种基组对应到现在我们常用的高斯型基组格式,比如6-31G(d)等。
谢谢。
通过忠实地映射宇宙来隐藏自我,是融入永恒的唯一途径。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-2-2 11:56:19 | 只看该作者 Only view this author
AMolPC 发表于 2016-2-2 10:33
问一个quick question,在有的文献中能看到将高斯型的基组写成诸如(3s2p)/[2s1p]等等两个括号的形式,这 ...

没有直接对应关系。那种表示方式是说此基组有3个s型和2个p型primitive shell,被收缩成2个s型和1个p型基函数shell。对应这种构成方式的基组可以有多个。所以只能是你把已知的基组给那么表示,但那种表示方式却没法唯一地对应基组。
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面壁者

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发表于 Post on 2016-2-2 13:22:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-2-2 11:56
没有直接对应关系。那种表示方式是说此基组有3个s型和2个p型primitive shell,被收缩成2个s型和1个p型基 ...

谢谢Sob老师。从您的描述来看,这个应该是很小的(系列)基组吧?
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本版积分规则 Credits rule

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