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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2018-9-14 11:19:49 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,您之前跟我说如果是两个气体,存在竞争吸附的情况下,是优先考虑哪个络合物更稳定。我就在想到了几个问题
1. 如果A气体B气体反应,有LH机理和ER机理。我们再考虑哪种机理更合理的时候,难道只要考虑两个机理下那种吸附更稳定吗?——LH机理下两个气体共吸附的能量和ER机理下络合物的能量比较(我做ER机理下也习惯把A,B放在一起得到一个总络合物)。
2. 我看到有这样一篇文献,报道是吸附CO的能量比吸附N2O的能量更高,但是吸附CO反应进行不下去,作者的反应物就从吸附N2O做起,这是不是说明不够合理啊?毕竟存在竞争吸附,CO的更高吸附能会对反应的进行造成很大影响吧?

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发表于 Post on 2018-9-14 16:53:59 | 只看该作者 Only view this author
请问老师现在有软件可以计算荧光或磷光量子产率吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-15 06:04:18 | 只看该作者 Only view this author
函数与激情 发表于 2018-9-14 16:53
请问老师现在有软件可以计算荧光或磷光量子产率吗?

牵扯到的因素非常多,没有简单的办法模拟
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-15 06:04:48 | 只看该作者 Only view this author
didi_dudu 发表于 2015-3-18 15:43
请问一下常用ECP中如ECPXXMDF的MDF是什么意思?是multiconfiguration Dirac±Hartree±
Fock (MCDHF) 的进 ...
DF是那个意思,M=Multi-electrons,指拟合赝势时考虑对一个以上价电子能量的重现
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-15 06:08:32 | 只看该作者 Only view this author
she 发表于 2018-9-13 18:09
sob老师,您好。请问:1.想计算离子液体中阴阳离子的相互作用能,是用这个分子体系总能量减去阴阳离子的能 ...

1 纯粹理论研究直接用复合物的结构即可,和实验数据对比才需要再优化阴阳离子
2 这种级别很不合适。优化应当用B3LYP-D3,基组用6-311G**就完全够了,单点时基组改用ma-TZVP(def2-TZVP上加弥散),或者图省事直接写jun-cc-pVTZ也可以。M06-2X可以用,但更昂贵,对于算结合能可能会好一点,但是对优化不会比B3LYP-D3有明显改进
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-15 06:10:07 | 只看该作者 Only view this author
329678001 发表于 2018-9-14 11:19
Sob老师,您之前跟我说如果是两个气体,存在竞争吸附的情况下,是优先考虑哪个络合物更稳定。我就在想到了 ...

这种长问题,干脆单独发个帖子吧,说不定有专门做这方面的人能提出更好的见解
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发表于 Post on 2018-9-15 06:19:45 | 只看该作者 Only view this author
老师,在过渡态搜索时,可不可以先用低精度的基组泛函(比如BLYP/3-21g)对初猜进行freq任务,检测是否存在虚频?并且观测其振动方向是否与预想中的反应方向一致去判断是否合理?   因为calcall用不起,本身也非物理化学出身导致化学直觉较差,就想着是否有些技巧。  还请老师指点,谢谢老师

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发表于 Post on 2018-9-15 08:08:10 | 只看该作者 Only view this author
有质子交换的配位过程,配位稳定化能和配位平衡常数的计算如何配平?
比如以下反应:
(M+)  +  HL = ML + (H+)
显然是没法计算单个质子的能量的。这个时候是加上M+对应的阴离子计算,还是计算溶剂以及,溶剂化质子的能量?

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发表于 Post on 2018-9-15 14:15:51 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,以下列关键词(#p m062x/6-31+g** opt(tight,calcall) freq EmpiricalDispersion=GD3 )进行计算时,由于时间关系被自动停掉了,如何进行续算?是SCF=restart吗?谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-16 10:17:46 | 只看该作者 Only view this author
ssfm 发表于 2018-9-15 14:15
老师您好,以下列关键词(#p m062x/6-31+g** opt(tight,calcall) freq EmpiricalDispersion=GD3 )进行计算 ...

看一下输出文件,如果当前还没优化完,直接提取最后结构,还用当前关键词继续优化就完了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-16 10:25:07 | 只看该作者 Only view this author
望月凝香 发表于 2018-9-15 08:08
有质子交换的配位过程,配位稳定化能和配位平衡常数的计算如何配平?
比如以下反应:
(M+)  +  HL = ML + ...

质子在溶剂下的热力学量可以算,参考比如Journal of Molecular Structure: THEOCHEM 952 (2010) 25–30里的讨论
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-16 10:26:30 | 只看该作者 Only view this author
刘小英雄steven 发表于 2018-9-15 06:19
老师,在过渡态搜索时,可不可以先用低精度的基组泛函(比如BLYP/3-21g)对初猜进行freq任务,检测是否存在 ...

不行
3-21G烂到连定性正确都没法保证
对有机反应,想快速地试过渡态,还不如用半经验或者xtb,耗时比BLYP/3-21G低两个数量级
找过渡态本来就不是非得用calcall,用了耗时增加一个数量级以上
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发表于 Post on 2018-9-16 10:52:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-9-16 10:26
不行
3-21G烂到连定性正确都没法保证
对有机反应,想快速地试过渡态,还不如用半经验或者xtb,耗时比BL ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2018-9-16 14:45:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-9-16 10:17
看一下输出文件,如果当前还没优化完,直接提取最后结构,还用当前关键词继续优化就完了

谢谢老师的耐心答复

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发表于 Post on 2018-9-16 16:38:58 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我想问一下如何用multiwfn做密度差图时使物质不随着坐标轴转,我想做一个密度差平面图观看一下某一个化学键周围电子密度变化?谢谢老师

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