计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

210

帖子

0

威望

1855

eV
积分
2065

Level 5 (御坂)

7561#
发表于 Post on 2018-9-11 14:11:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-9-11 11:54
从电子结构、能量等方面上,对映异构体都是体现不出差异的
一般都是通过VCD、ECD、光学旋转等来考察

谢谢sob老师。

42

帖子

0

威望

442

eV
积分
484

Level 3 能力者

7562#
发表于 Post on 2018-9-11 16:05:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-11 18:37
物理本质不同,反映的问题也不同
电子密度拉普拉斯函数并不能展现出氢键
很多密度差图能体现的问题电子 ...

老师我想问一下这篇文章这样说对不对?

QQ截图20180911160241.png (165.51 KB, 下载次数 Times of downloads: 23)

拉普拉斯值与氢键关系

拉普拉斯值与氢键关系

78

帖子

0

威望

814

eV
积分
892

Level 4 (黑子)

7563#
发表于 Post on 2018-9-11 16:25:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-9-11 11:51
对于绘图,要么图省事用电子能垒,要么求化学意义用G,用U(0)什么都不是,除非你要研究0K下的反应
绘制 ...

                       Q            Log10(Q)             Ln(Q)
Total Bot       0.229396D-12        -12.639414        -29.103327
Total V=0       0.918747D+08          7.963196         18.335937
请问这里分别是Gaussian输出的配分函数Q(v=0)和Q(bot)吗
自己决定自己的DNA

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125181

管理员

公社社长

7564#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-11 20:15:09 | 只看该作者 Only view this author
ssfm 发表于 2018-9-11 16:05
老师我想问一下这篇文章这样说对不对?

波函数分析问题请发到专门的帖子http://bbs.keinsci.com/thread-10181-8-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125181

管理员

公社社长

7565#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-11 20:20:12 | 只看该作者 Only view this author
QuantumHan 发表于 2018-9-11 16:25
Q            Log10(Q)             Ln(Q)
Total Bot       0.229396D-12       ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

42

帖子

0

威望

442

eV
积分
484

Level 3 能力者

7566#
发表于 Post on 2018-9-11 21:14:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-9-11 20:15
波函数分析问题请发到专门的帖子http://bbs.keinsci.com/thread-10181-8-1.html

好的 谢谢老师

586

帖子

0

威望

4192

eV
积分
4778

Level 6 (一方通行)

7567#
发表于 Post on 2018-9-11 21:55:14 | 只看该作者 Only view this author

geom=check guess=read与geom=allcheck guess=read

本帖最后由 15whyhq 于 2018-9-11 21:56 编辑

geom=check guess=read与geom=allcheck guess=read这两个是一样的吗?都是用来读chk文件的?geom=allcheck guess=read可以写成guess=check?谢谢!

195

帖子

0

威望

699

eV
积分
894

Level 4 (黑子)

7568#
发表于 Post on 2018-9-11 22:18:32 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,有多种方法可以表征电荷转移特征,delta_r index, 电子-空穴距离,还有做电子密度差时的C+-C_的距离,这三者有什么区别吗?
(2)电子-空穴分析与电子密度差分析,都仅是用来说明该激发是CT激发、LE激发的吗?有何区别呢?

2494

帖子

11

威望

7054

eV
积分
9768

Level 6 (一方通行)

7569#
发表于 Post on 2018-9-11 22:19:43 | 只看该作者 Only view this author
1,geom=check guess=read能够从chk文件里读取几何坐标,并将chk文件里收敛的波函数作为初猜
geom=allcheck guess=read不但可以做到上述的目的,还可以从chk文件里读取体系的整体电荷和自旋多重度,以及标题

2,guess=check这种写法是不存在的,要参照手册的格式规范书写关键词

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125181

管理员

公社社长

7570#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-12 05:19:00 | 只看该作者 Only view this author
Theor_Comp 发表于 2018-9-11 22:18
Sob老师,有多种方法可以表征电荷转移特征,delta_r index, 电子-空穴距离,还有做电子密度差时的C+-C_的距 ...

波函数分析问题请发到
http://bbs.keinsci.com/thread-10181-1-1.html

仔细阅读此文,我认为应该不会对此存有疑问
使用Multiwfn做空穴-电子分析全面考察电子激发特征
http://sobereva.com/434
文中说了,电子-空穴分析本身就能计算密度差,文中也明确说了弛豫激发态密度和非弛豫密度的关系

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125181

管理员

公社社长

7571#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-12 05:21:15 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2018-9-11 21:55
geom=check guess=read与geom=allcheck guess=read这两个是一样的吗?都是用来读chk文件的?geom=allcheck  ...

这种问题直接去看手册,看不懂的去试,还弄不懂的直接用首页google框搜论坛,别瞎猜
7575L也已经回复了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

14

帖子

0

威望

73

eV
积分
87

Level 2 能力者

7572#
发表于 Post on 2018-9-12 16:51:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-9-11 11:48
这种老生常谈的问题用论坛首页google框100%能搜到正确解决办法。

好的,谢谢Sob老师!

146

帖子

0

威望

1329

eV
积分
1475

Level 4 (黑子)

7573#
发表于 Post on 2018-9-12 22:57:34 | 只看该作者 Only view this author
老师,在做柔性扫描的时候,能不能对键角的上下限进行设置,比如NO2的键角在达到134度的时候扫描停止。还麻烦老师能解答一下,辛苦sob老师

175

帖子

0

威望

1057

eV
积分
1232

Level 4 (黑子)

7574#
发表于 Post on 2018-9-12 23:19:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 329678001 于 2018-9-12 23:20 编辑

sob老师您好,咨询您一下反应路径的问题。下面这个图开始是吸附CO,然后吸附O2或者N2O。图上可以看到是优先吸附O2的,但是N2O的这条路径上的能垒更低啊。怎么判断哪个路径更合理呢? 感谢老师

2cea80bbdba8044c3bfd2d79405f128.png (66.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 20)

2cea80bbdba8044c3bfd2d79405f128.png

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125181

管理员

公社社长

7575#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-13 04:06:39 | 只看该作者 Only view this author
刘小英雄steven 发表于 2018-9-12 22:57
老师,在做柔性扫描的时候,能不能对键角的上下限进行设置,比如NO2的键角在达到134度的时候扫描停止。还麻 ...

不能
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 22:43 , Processed in 1.055452 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list