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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2016-3-14 13:32:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-11 14:57
经典势垒。实际计算时用过渡态的U(0)减去反应物的U(0)

那就是说指数部分和我给出的那个公式是一样吧?看来是我前面少乘了Na*V,谢谢老师的指点!

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发表于 Post on 2016-3-14 14:11:34 | 只看该作者 Only view this author
lei234 发表于 2016-3-14 07:23
您说的MOPAC可以用高斯算吗?

MOPAC是一个程序,不是方法。在层次上和高斯是并列的。

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发表于 Post on 2016-3-14 15:44:38 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 14xlliu 于 2016-3-14 15:49 编辑

如果我要对某个框架进行配体修饰,我要从一个邻苯二甲酸变成如下形式的话,我应该用什么软件来编辑并获得一个合理的晶胞框架呢?

含三个苯酸.png (17.24 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)

含三个苯酸.png

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发表于 Post on 2016-3-14 17:06:10 | 只看该作者 Only view this author

如何生成fchk文件

chk文件生成不了fchk文件是什么情况?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-14 18:25:20 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-3-14 17:06
chk文件生成不了fchk文件是什么情况?

问问题要把当前情况描述详细,否则无法回答
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-14 18:26:16 | 只看该作者 Only view this author
14xlliu 发表于 2016-3-14 15:44
如果我要对某个框架进行配体修饰,我要从一个邻苯二甲酸变成如下形式的话,我应该用什么软件来编辑并获得一 ...

晶胞框架指什么?
光是画个分子用gview足矣。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-14 18:26:32 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2016-3-14 13:32
那就是说指数部分和我给出的那个公式是一样吧?看来是我前面少乘了Na*V,谢谢老师的指点!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-14 18:27:07 | 只看该作者 Only view this author
fankui1990129 发表于 2016-3-14 01:26
请问KiSThelP(http://sobereva.com/246)可以计算三分子反应么?我手上有一个反应机理是三分子一本反应, ...

不能
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-14 18:27:45 | 只看该作者 Only view this author
lei234 发表于 2016-3-14 07:18
很感谢您的耐心指导。
目前的情况是老师想让我尽量用高斯算,所以请问您在方法上有什么好的建议么?您上 ...


非要用高斯或非要用ONIOM,对此体系的研究没什么前景,折腾来折腾去时间都浪费了。
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发表于 Post on 2016-3-14 19:47:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-14 18:26
晶胞框架指什么?
光是画个分子用gview足矣。

金属有机框架,如对cpm系列的配体进行配体修饰,再进行吸附计算。所以怎么在原来的晶胞基础上画出新的金属有机框架的晶胞

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-14 20:28:59 | 只看该作者 Only view this author
14xlliu 发表于 2016-3-14 19:47
金属有机框架,如对cpm系列的配体进行配体修饰,再进行吸附计算。所以怎么在原来的晶胞基础上画出新的金 ...

可以用MS
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发表于 Post on 2016-3-14 20:41:24 | 只看该作者 Only view this author

Linux下高斯怎样提交任务?

大家好, 之前用过Windows版高斯用gauss view连接高斯提交任务,但刚接触Linux,装了高斯09,求教Linux怎样提交任务?是要安装Linux 版的gauss view才能提交任务?先谢谢大家啦!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-14 21:27:36 | 只看该作者 Only view this author
fzmn 发表于 2016-3-14 20:41
大家好, 之前用过Windows版高斯用gauss view连接高斯提交任务,但刚接触Linux,装了高斯09,求教Linux怎样 ...


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发表于 Post on 2016-3-15 01:04:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-14 18:27
非要用高斯或非要用ONIOM,对此体系的研究没什么前景,折腾来折腾去时间都浪费了。

可我们服务器上没有MOPAC啊,难道要在单机上算?

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发表于 Post on 2016-3-15 01:07:32 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-3-14 14:11
MOPAC是一个程序,不是方法。在层次上和高斯是并列的。

谢谢您的回复,只是不知道在要在哪里算。。我看到网上有免费的MOPAC下载,是要在单机上算吗?那岂不是专门一台计算机放那里算?

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