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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2020-5-24 16:15:16 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 naonao5205 于 2020-5-24 22:09 编辑

sob老师您好,1)请问DLPNO-CCSD(T)和可以和RI-MP2结合cc-pVTZ/cc-pVQZ进行外推吗?如果使用MP2/大基组推测CCSD(T)/大基组结果,MP2能否开RI呢?在DLPNO-CCSD(T)里SCF部分使用RI-JK加速,如果想用RI-MP2来估计的话是否应该同样用RI-JK呢?2)如果是F元素的阴离子体系(仅有一个负电),计算能量的时候弥散函数是必须的吗、如果使用基组很大的情况下?(比如def2-QZVPP、cc-pVQZ)?如果是电负性没有这么大的原子呢? 3) 在orca中使用月份函数的时候可以借用aug-cc-pVnZ的辅助基吗?

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发表于 Post on 2020-5-24 20:56:56 | 只看该作者 Only view this author
社长,请问一下高斯里面的wB97XD3是写为wb97xd em=gd3bj还是wb97x em=gd3bj呢?
The leaping arc at your finger
is my faith and will eliminate never
Only the railgun will live forever

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发表于 Post on 2020-5-24 23:56:54 | 只看该作者 Only view this author
社长大人,Gaussian输出文件中的Electronic spatial extent (au) 这里的原子单位如果非要写成常用单位 应该是什么?
恍惚月余,深谙人与人之间的差距。以后还应努力学习,才能与强者比肩。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-25 03:48:22 | 只看该作者 Only view this author
ABetaCarw 发表于 2020-5-24 23:56
社长大人,Gaussian输出文件中的Electronic spatial extent (au) 这里的原子单位如果非要写成常用单位 应该 ...

Bohr^2
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-25 03:49:03 | 只看该作者 Only view this author
linqiaosong 发表于 2020-5-24 20:56
社长,请问一下高斯里面的wB97XD3是写为wb97xd em=gd3bj还是wb97x em=gd3bj呢?

Gaussian里没法用wB97X-D3
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-25 03:49:59 | 只看该作者 Only view this author
dali 发表于 2020-5-24 13:55
sob老师,我在Gaussian 09-e01版本,B3LYP-D3/6-311G(d)的计算水平下优化结构,出现了103错误,Maximum of* ...

看不懂你的意思。前面说优化出错,怎么后面又说构型优化是正常结束的
最好上传压缩后的输出文件
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-25 03:51:42 | 只看该作者 Only view this author
naonao5205 发表于 2020-5-24 16:15
sob老师您好,1)请问DLPNO-CCSD(T)和可以和RI-MP2结合cc-pVTZ/cc-pVQZ进行外推吗?如果使用MP2/大基组推测 ...

1 可以。能。是
2 即便是4-zeta,算阴离子能量仍然需要用弥散函数
3 可以

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naonao5205 + 5 谢谢

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发表于 Post on 2020-5-25 09:56:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-5-25 03:49
看不懂你的意思。前面说优化出错,怎么后面又说构型优化是正常结束的
最好上传压缩后的输出文件

sob老师,整体作业是显示103错误,具体查的时候有一个normal,发现是结构优化正常结束,而算频率时发生了103错误。

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发表于 Post on 2020-5-25 15:13:35 | 只看该作者 Only view this author

计算萌新,想请教下大佬们,我这个计算哪里出问题了,一个多礼拜了都没算出来,一...

本帖最后由 MadStarJ 于 2020-5-25 15:13 编辑

之前计算不加金属离子的这个结构,算出来结果了,加了Zn离子之后,就一直没算出来,一直报错
关键词:# opt=cartesian b3lyp/gen geom=connectivity基组:

Zn 0
Lanl2DZ
****
C H N O S Cl 0
6-31G
****


Zn 0
Lanl2DZ


CW13.gjf

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发表于 Post on 2020-5-25 15:18:30 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 thanhtam 于 2020-5-25 15:29 编辑

基组不加极化等于浪费电
看:
谈谈量子化学中基组的选择
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... =3545&fromuid=19288
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373

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发表于 Post on 2020-5-25 15:22:23 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 AndrewX 于 2020-5-25 15:23 编辑

零基础入门学习量子化学计算,在阅读《详谈使用Gaussian做势能面扫描》一文尝试练习时有点小问题,问题出在“刚性扫描实例3:扫描氟化氢键长获得解离曲线”,按照帖子中的输入文件如下:
%chk=HF_broken.chk
%nprocshared=7
%mem=1GB
# UB3LYP/def2TZVP guess=mix stable=opt

Title Card Required

0 1
F
H      1 B1

B1  4.0

报错文件如下:
QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
# UB3LYP/def2TZVP guess=mix stable=opt
                '
Last state="GCL"
TCursr= 1046 LCursr=    9
Error termination via Lnk1e in /home/chenxiuting/Program/g09/l1.exe at Mon May 25 15:27:50 2020.

在查阅论坛中的常见报错解决办法中得知是输入文件关键词或语法错误,我排除了中英文输入法混淆的可能性,也检查了输入文件,与帖中对照是一样的,仍然是上述报错,后面的HF_scan和H2O_2Dscan的示例也是一样的报错。单引号都在定位在def下方。请问可能是哪里出了问题呢?

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发表于 Post on 2020-5-25 15:33:47 | 只看该作者 Only view this author
AndrewX 发表于 2020-5-25 15:22
零基础入门学习量子化学计算,在阅读《详谈使用Gaussian做势能面扫描》一文尝试练习时有点小问题,问题出在 ...

G09 B以前的版本没有内置def2系列基组

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发表于 Post on 2020-5-25 15:41:23 | 只看该作者 Only view this author
thanhtam 发表于 2020-5-25 15:33
G09 B以前的版本没有内置def2系列基组

G09 B是指什么呢,G09中的一个小版本吗,我用的就是G09W Version7.0

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发表于 Post on 2020-5-25 15:50:25 | 只看该作者 Only view this author
AndrewX 发表于 2020-5-25 15:41
G09 B是指什么呢,G09中的一个小版本吗,我用的就是G09W Version7.0

输出文件开头,在引用方式之后,会显示高斯版本

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Yukikaze

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发表于 Post on 2020-5-25 16:50:51 | 只看该作者 Only view this author
“Warning!  S  atom   12 may be hypervalent but has no d functions.”

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