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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-26 16:17:37 | 只看该作者 Only view this author
xuhj199508 发表于 2020-5-25 16:50
“Warning!  S  atom   12 may be hypervalent but has no d functions.”

基组设置不当
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-26 16:18:24 | 只看该作者 Only view this author
dali 发表于 2020-5-25 09:56
sob老师,整体作业是显示103错误,具体查的时候有一个normal,发现是结构优化正常结束,而算频率时发生了 ...

没输出文件没法说
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-26 16:19:13 | 只看该作者 Only view this author
MadStarJ 发表于 2020-5-25 15:13
之前计算不加金属离子的这个结构,算出来结果了,加了Zn离子之后,就一直没算出来,一直报错
关键词:# op ...

得写成genecp,否则连赝势根本都不读入
仔细看
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60
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发表于 Post on 2020-5-28 15:58:57 | 只看该作者 Only view this author

IRC只走了三个点就正常结束了

对于IRC只走了3个点就正常结束了,可是我在对于过渡态分析时,看到它的震动方向是正确的。我看别人解决时,换了溶剂模型,如果我也要换,我在找过渡态时,溶剂模型是否也应该改

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发表于 Post on 2020-5-28 16:03:28 | 只看该作者 Only view this author
《在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题》
http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-28 18:58:17 | 只看该作者 Only view this author
郭德来 发表于 2020-5-28 15:58
对于IRC只走了3个点就正常结束了,可是我在对于过渡态分析时,看到它的震动方向是正确的。我看别人解决时, ...

老生常谈问题求助前先搜公社首页google框
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html

跟溶剂模型没必然的关系
IRC和找TS用的溶剂模型必须严格相同

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发表于 Post on 2020-5-29 09:51:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-5-28 18:58
老生常谈问题求助前先搜公社首页google框
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/4 ...

那老师,我整个反应是由多个基元反应组成,如果一个基元反应加了int=ultrafine,或者用了calcall,我其他的基元反应是否也应该加?

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发表于 Post on 2020-5-29 14:24:23 | 只看该作者 Only view this author
郭德来 发表于 2020-5-29 09:51
那老师,我整个反应是由多个基元反应组成,如果一个基元反应加了int=ultrafine,或者用了calcall,我其他 ...

格点应该保持一致 calcall没必要

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发表于 Post on 2020-5-29 23:41:57 | 只看该作者 Only view this author

化学反应速率常数计算

举个例子:
CF4---CF3+F
如何读取其中的相关数据,然后计算化学反应速率常数?

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发表于 Post on 2020-5-30 00:38:52 | 只看该作者 Only view this author
你写的化学反应方程式的等号右边的两个物种,应该是电中性的吧?

如果是这样的话,把你写的化学反应方程式换个方向,就是两个自由基的偶联。我觉得,你要是尝试去找真空气相下这个反应的过渡态的话,很可能会遇上势能面上没有一阶鞍点的情况。如果是这种情况的话,你可能要用到变分过渡态理论了。或者说,你写的这个反应,不适合才刚刚上手的人去做。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-30 07:12:51 | 只看该作者 Only view this author

谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生
http://sobereva.com/506http://bbs.keinsci.com/thread-14313-1-1.html
基于过渡态理论计算反应速率常数的Excel表格
http://sobereva.com/310http://bbs.keinsci.com/thread-2350-1-1.html
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发表于 Post on 2020-5-30 16:06:08 | 只看该作者 Only view this author

Gaussian 09W 2070错误


有没有大佬可以帮忙看一下哪里有问题呀?入门小白,按老师教的步骤进行计算,其他分子都没出问题,唯独到了这个分子在am1结构优化的时候就出现了错误,尝试了很多次分子结构式没有问题,输入文件我放在附件里了,输出文件太大了上传不了,麻烦各位帮忙看看问题出在哪里,应该怎么解决?


HZY-TPO-sulfoxide-meta-butyl1-am1.gjf

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-30 17:14:22 | 只看该作者 Only view this author
zhenyeehan 发表于 2020-5-30 16:06
有没有大佬可以帮忙看一下哪里有问题呀?入门小白,按老师教的步骤进行计算,其他分子都没出问题,唯独到 ...

贴图方式不对。仔细看置顶的新社员必读贴,别直接往帖子里粘。论坛不是word或者QQ窗口

这年头谁还用AM1,早过时了

Gaussian里绝对不要用CPCM,仔细看
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html

提问时候别用2070这种方式提问,仔细看
提问Gaussian问题的注意事项;Gaussian FAQ
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发表于 Post on 2020-5-31 10:50:08 | 只看该作者 Only view this author
请教大家一个问题。高斯TDDFT结果文件中,每个轨道跃迁后面的小数(如104 --- 105   0.6552)准确来说叫什么?谢谢

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发表于 Post on 2020-5-31 18:22:53 | 只看该作者 Only view this author
Daniel_Arndt 发表于 2020-5-30 00:38
你写的化学反应方程式的等号右边的两个物种,应该是电中性的吧?

如果是这样的话,把你写的化学反应方程 ...

加了溶剂化也不行么

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