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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-3 15:55:05 | 只看该作者 Only view this author
霜晨月 发表于 2022-3-3 11:37
我用B3LYP/def2-SV(P)做了一批分子的opt freq,接下来要计算热力学数据,发现没有这个级别的频率校正因子。 ...

拿6-31G*的凑合
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-3 15:55:19 | 只看该作者 Only view this author
1983984613 发表于 2022-3-3 14:40
老师好,用了您给的关键词#p opt=calcall  b3lyp/6-311+g(d) em=gd3bj  scrf=solvent=THF 。我跑了下,现 ...

没看见你的附件
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-3 15:55:35 | 只看该作者 Only view this author
wy标点人生 发表于 2022-3-3 09:31
老师,是在高斯16上进行结构优化,任务中断了,结点出现“down”的情况。

opt里写上restart,重新提交
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发表于 Post on 2022-3-3 16:02:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-3 15:55
没看见你的附件

我也不知道咋回事,我自己是看得到的, BnMgbr-1.rar (347.32 KB, 下载次数 Times of downloads: 7) ,我再尝试下上传。



202203031601175340..png (33.51 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

202203031601175340..png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-3 16:52:11 | 只看该作者 Only view this author
1983984613 发表于 2022-3-3 16:02
我也不知道咋回事,我自己是看得到的, ,我再尝试下上传。

参考这里面的关键词

x.rar (78.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)
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发表于 Post on 2022-3-3 16:57:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-3 16:52
参考这里面的关键词

好的,谢谢老师了,我马上修改。

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发表于 Post on 2022-3-3 17:52:48 | 只看该作者 Only view this author

好的,多谢社长

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发表于 Post on 2022-3-3 18:19:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-3 16:52
参考这里面的关键词

谢谢sob老师,已经算出来了。

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发表于 Post on 2022-3-3 18:27:39 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,我要算的是氮气在电子包合水合物中还原的情况,向一个水笼中加入一个电子优化后,查看了自旋密度分布情况,
但是用什么方法可以算出水笼捕获的电子占总电子数的百分比 ?
向电子水笼中继续加入氮气优化后,氮氮键拉长,同样用什么可以查看氮气上的过剩电子=?

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发表于 Post on 2022-3-3 19:52:48 | 只看该作者 Only view this author
请教大家,第一张图片里的L之前看过sob老师的解释“σ=σ(R)*n(TS)/ [σ(TS)*n(R)],这里σ(R)和σ(TS)指的是反应物和过渡态结构的转动对称数,n(R)和n(TS)指的是反应物和过渡态结构的手性异构体数目。在Gaussian计算时,只要点群识别对了,在freq任务输出文件中看到的Rotational symmetry number就是指的这个转动对称数”。但是现在不太明白图片里黄色强调文字的描述。①为什么对于H2O2做谐振子近似和受阻转子处理时n=2和1?是因为键不能自由旋转吗?②环状结构怎么也属于这种情况呢,是不同构型做受阻转子处理不能自由旋转吗?麻烦老师们解释一下,谢谢。

202203031949363543..png (73.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 55)

202203031949363543..png

202203031949488509..png (28.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

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发表于 Post on 2022-3-3 20:43:32 | 只看该作者 Only view this author

piperazine分子的LUMO大于0

B3LYP 6-31g(d)基组计算,结构及能级图如下图所示

LUMO大于0,是怎么回事呢

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争取学好计算化学!

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发表于 Post on 2022-3-3 20:56:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-3 15:55
opt里写上restart,重新提交

好滴,谢谢老师!
始终相信生活美好,万物可爱!

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发表于 Post on 2022-3-3 21:29:32 | 只看该作者 Only view this author
你为什么认为它不应该大于0?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-3 21:39:14 | 只看该作者 Only view this author
Lyy1 发表于 2022-3-3 18:27
各位老师好,我要算的是氮气在电子包合水合物中还原的情况,向一个水笼中加入一个电子优化后,查看了自旋密 ...

把具体结构图贴出来
反正用Multiwfn肯定能实现
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-3 21:44:53 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2022-3-3 19:52
请教大家,第一张图片里的L之前看过sob老师的解释“σ=σ(R)*n(TS)/ [σ(TS)*n(R)],这里σ(R)和σ(TS)指的 ...

谐振近似相当于把H2O2当做一个C2h结构的刚性分子,这时候根据显然要考虑转动对称数

如果用受阻转子方式考虑,相当于H2O2的O-O可以旋转,旋转后结构就不存在C2h对称性了
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