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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2022-3-17 16:53:20 | 只看该作者 Only view this author
chaofuL 发表于 2022-3-17 09:51
各位老师好,我想求解的是经Gaussian 09使用< # opt=(calcfc,ts,gdiis) freq b3lyp/6-311+g(2d,2p) geom=co ...

自己在http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html里查找解决方法,找不到再来问。以后也都是如此,只有在那个帖子里找不到的报错才能发帖问。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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发表于 Post on 2022-3-17 16:55:23 | 只看该作者 Only view this author
化小白 发表于 2022-3-17 08:18
老师,您好,我想问一下,过渡态中这种似成键未成键的结构,构型怎么判断是R型还是S型,比如,如果认为是成 ...

一般不谈论过渡态的手性,而是说反应是在反应物的哪个潜手性面(Re面、Si面)发生的。也就是按反应物的潜手性面而非过渡态本身的手性来讨论问题。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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发表于 Post on 2022-3-17 17:10:57 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-3-17 16:53
自己在http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html里查找解决方法,找不到再来问。以后也都是如此,只 ...

一开始我在左上角那三个搜索栏里搜索了相应的报错关键词,发现导致原因不一样。
非常感谢老师的指点迷津,我再按您的推荐查查原因,谢谢您。

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发表于 Post on 2022-3-17 17:32:34 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-3-17 16:55
一般不谈论过渡态的手性,而是说反应是在反应物的哪个潜手性面(Re面、Si面)发生的。也就是按反应物的潜 ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2022-3-17 17:59:04 | 只看该作者 Only view this author

隐式溶剂模型中结构优化及能量计算

我的输入文件如下,提交高斯任务之后总是错误输出,输出文件告诉我PCM书写不规范,不知道是什么问题,想求助一下?

202203171755319345..png (47.11 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

202203171755319345..png

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发表于 Post on 2022-3-17 18:12:08 | 只看该作者 Only view this author
请问各位老师 最近几次gaussian跑的任务的chk文件都打不开 显示这些 以前从来没有过 突然出现这种情况 不知道是什么原因以及如何解决

a3dffab7e8761503985133b52363188.png (18.22 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

文本编辑器打开chk文件显示

文本编辑器打开chk文件显示

cf723351653e1e1c584ab968b22b987.png (19.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

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发表于 Post on 2022-3-17 18:33:35 | 只看该作者 Only view this author
雾雨魔理沙daze 发表于 2022-3-17 18:12
请问各位老师 最近几次gaussian跑的任务的chk文件都打不开 显示这些 以前从来没有过 突然出现这种情况 不知 ...


《在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚》http://sobereva.com/620

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现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2022-3-17 18:45:52 | 只看该作者 Only view this author
是不是应该用iefpcm

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发表于 Post on 2022-3-17 18:53:58 | 只看该作者 Only view this author
雾雨魔理沙daze 发表于 2022-3-17 11:12
请问各位老师 最近几次gaussian跑的任务的chk文件都打不开 显示这些 以前从来没有过 突然出现这种情况 不知 ...

上传你打不开的chk文件和你以前能打开的chk文件,以及两个计算的完整输入输出文件
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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发表于 Post on 2022-3-17 19:03:25 | 只看该作者 Only view this author
看起来没问题,我用同样关键词优化任意结构可以顺利运行
建议还是上传输入输出文件吧

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发表于 Post on 2022-3-17 19:17:06 | 只看该作者 Only view this author
文件最后少个空行。

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发表于 Post on 2022-3-17 21:17:14 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-3-16 18:43
对,不过注意金属轨道不止一个,配体轨道也不止一个,所以有可能有不止一对轨道都符合3ES或者3MC的定义, ...

恩这个我考虑到了,谢谢老师提醒,我又算了一个体系,mc对应的轨道是homo-5和lumo+10,我在前40个激发态中都没找到对应的激发,那对于这种体系该如何处理?继续算更多的激发态还有意义吗,结果还准确吗

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发表于 Post on 2022-3-17 21:39:02 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2022-3-17 19:17
文件最后少个空行。

谢谢,我又提交了一遍,确实是这个问题。

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发表于 Post on 2022-3-17 22:13:53 | 只看该作者 Only view this author
好兄弟 发表于 2022-3-17 14:17
恩这个我考虑到了,谢谢老师提醒,我又算了一个体系,mc对应的轨道是homo-5和lumo+10,我在前40个激发态 ...

MC态在平衡位置附近可能确实很高,这时一种方法是继续往更高的激发态找,另一种方法是按照化学常识适当扭曲结构,选择性地降低MC态的能量,再找
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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14880#
发表于 Post on 2022-3-17 22:32:34 | 只看该作者 Only view this author

UV-vis 模拟用什么泛函比较合适?

最近要算几个小分子(非常小,碳五元环和六元环上带两个COOCH3)的紫外可见吸收谱,请大家推荐一下用什么泛函和机组好?先谢谢了!

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