简单量子化学问题答疑专帖

chennanjie · 发表于 Post on 2023-1-4 10:32:14

anson 发表于 2023-1-4 10:26
只用2个核心进行计算是不是有点少了？内存的设置也感觉少了点。
看上去gjf输入文件倒是没有什么问题。

以前计算HOMO和LUMO的时候，使用的是2个核心和1G的内存设置的，当时可以计算出来。
但是一开始我使用这个新的GIF文件计算就出问题了，没法计算。
错误如下：
%nprocshared=2
Will use up to 2 processors via shared memory.
%mem=1000MB
%chk=C:\Users\Win10\Desktop\GS caculate\TTF-BMEEC\solvation free energy\2.chk
-------------------------------
# M05-2X/6-31g(d) geom=allcheck
-------------------------------
QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
# M05-2X/6-31g(d) geom=allcheck
   '
Last state= "GCL"
TCursr=    3656 LCursr=       6
Error termination via Lnk1e in D:\GS\G09W\l1.exe at Wed Jan 04 10:11:01 2023.
Job cpu time:    0 days  0 hours  0 minutes  0.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    1 Int=    0 D2E=    0 Chk=    1 Scr=    1

snljty2 · 发表于 Post on 2023-1-4 10:50:02

chennanjie 发表于 2023-1-4 10:32
以前计算HOMO和LUMO的时候，使用的是2个核心和1G的内存设置的，当时可以计算出来。
但是一开始我使用这 ...

下面已经很明确标出来你关键词的错误了。M05-2X在Gaussian里写作M052X。另外，看手册http://gaussian.com/dft/的Keywords: Hybrid Functionals页搜M052X

sobereva · 发表于 Post on 2023-1-4 11:01:31

chennanjie 发表于 2023-1-4 09:59
谢谢老师，我现在就用直接编辑的方式试一下。
有错误立刻改正，有新事物立刻学习。
但是我还是不明白为 ...

甭用老掉牙的5.0.8

chennanjie · 发表于 Post on 2023-1-4 11:09:18

sobereva 发表于 2023-1-4 11:01
甭用老掉牙的5.0.8

sob老师有没有其他版本的推荐？感谢

站内有地方下载好用适合版本的其他的Gaussian view吗？

chennanjie · 发表于 Post on 2023-1-4 11:11:02

snljty2 发表于 2023-1-4 10:50
下面已经很明确标出来你关键词的错误了。M05-2X在Gaussian里写作M052X。另外，看手册http://gaussian.com ...

感谢你的回复，改成M052X之后计算比上次继续了一些，但是很快大约2秒还是停止额。

Gaussian 09:  IA32W-G09RevD.01 24-Apr-2013
            04-Jan-2023
******************************************
%nprocshared=2
Will use up to 2 processors via shared memory.
%mem=1000MB
%chk=C:\Users\Win10\Desktop\GS caculate\TTF-BMEEC\solvation free energy\3.chk
------------------------------
# M052X/6-31g(d) geom=allcheck
------------------------------
1/29=7,38=1/1;
2/12=2,40=1/2;
3/5=1,6=6,7=1,11=2,14=-4,16=1,25=1,30=1,74=-38/1,2,3;
4//1;
5/5=2,38=5/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
99/5=1,9=1/99;
Structure from the checkpoint file:  "C:\Users\Win10\Desktop\GS caculate\TTF-BMEEC\solvation free energy\3.chk"
FileIO operation on non-existent file.
FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=-20502 Len=       50 IPos=          2 Q=       14444784

dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles = 14 SizExt = 524288 WInBlk =    512
               defal = T LstWrd =    622080 FType=2 FMxFil=10000

Number             0          501          502          598          989          991
Base          96256       23552       41472       44032       24576       37888
End          622080       24552       43525       44034       37076       41169
End1          622080       24576       44032       44544       37376       41472
Wr Pntr       96256       23552       41472       44032       24576       37888
Rd Pntr       96256       23552       41472       44032       24576       41169
Length       525824       1000       2053          2       12500       3281

Number          992          993          994          995          996          997
Base          37376       23040       20480       22528       21504       22016
End          37381       23140       20510       22538       21604       22072
End1          37888       23552       20992       23040       22016       22528
Wr Pntr       37376       23040       20480       22528       21504       22016
Rd Pntr       37381       23140       20510       22538       21604       22072
Length             5          100          30          10          100          56

Number          998          999
Base          20992       44544
End          21192       95796
End1          21504       96256
Wr Pntr       20992       44544
Rd Pntr       21192       45796
Length          200       51252

dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles =    1 SizExt =       0 WInBlk =    512
               defal = F LstWrd =    67072 FType=2 FMxFil=10000

Number             0
Base          20480
End          67072
End1          67072
Wr Pntr       20480
Rd Pntr       20480
Length       46592

dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =    1 SizExt = 524288 WInBlk =    512
               defal = T LstWrd =    67072 FType=2 FMxFil=10000

Number             0
Base          20480
End          67072
End1          67072
Wr Pntr       20480
Rd Pntr       20480
Length       46592
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.

关于你说的哪个网站，应该是想让我看文献，我已经下载了2006的有关M052X的文献，我先试试看能不能看懂233

sobereva · 发表于 Post on 2023-1-4 11:18:13

chennanjie 发表于 2023-1-4 11:11
感谢你的回复，改成M052X之后计算比上次继续了一些，但是很快大约2秒还是停止额。

Gaussian 09: IA32 ...

chk文件路径没写对
跟看原文毫无关系

sobereva · 发表于 Post on 2023-1-4 11:18:53

chennanjie 发表于 2023-1-4 11:09
sob老师有没有其他版本的推荐？感谢
站内有地方下载好用适合版本的其他的Gaussian view吗？

论坛里公开求商业程序是严重违规行为，下次再求直接封号。仔细看置顶的社员必读贴再发帖

最起码用5.0.9

以后输入文件绝对不要把内容贴出来，而必须作为附件上传

chennanjie · 发表于 Post on 2023-1-4 11:38:48

sobereva 发表于 2023-1-4 11:18
论坛里公开求商业程序是严重违规行为，下次再求直接封号。仔细看置顶的社员必读贴再发帖

最起码用5.0. ...

好的，收到。谢谢sob老师。以后输入文件我都将按照附件上传，那么其他文件比如错误的文件可以贴出来吗还是也是作为附件上传呢？

关于路径，我这一路径有什么问题吗，这一保存路径已经计算过之前的结构优化和频率计算。我以为是没什么问题，当然了我现在马上修改一下路径保存在桌面上，看看能不能解决一些问题。

anson · 发表于 Post on 2023-1-4 17:40:28

chennanjie 发表于 2023-1-4 11:38
好的，收到。谢谢sob老师。以后输入文件我都将按照附件上传，那么其他文件比如错误的文件可以贴出来吗还 ...

chk文件路径里面最好不要带空格，极易出错；路径太长也有可能是报错的原因之一

小翟w · 发表于 Post on 2023-1-4 18:09:14

MoF4O-C2H2.inp (19.74 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

MoF4O-C2H2.out (11.99 KB, 下载次数 Times of downloads: 2) 老师们，请教一下，这个能量分解一直算不出来，这是输入文件和输出文件，想让老师看看那个地方不对

小翟w · 发表于 Post on 2023-1-4 18:11:18

老师们，请教一下，怎么用BSSE修正能量

chands · 发表于 Post on 2023-1-4 19:27:20

小翟w 发表于 2023-1-4 18:11
老师们，请教一下，怎么用BSSE修正能量

谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理 http://sobereva.com/46

KSeGaSn · 发表于 Post on 2023-1-4 20:19:54

请教各位老师，我在Gaussian结合TDDFT计算激发态，想要研究分子S1/T1/T2等激发态的弛豫结构的前线轨道特征。因此我在进行了singlets root=1 和triplets root=1/2等优化计算，得到弛豫的激发态结构后用eqsolv+density关键词做单点计算，理应存储在fch文件里的就是激发态的波函数了吧（在chk里确实也输出了total CI density），可以用Multiwfn直接分析并生成前线轨道的cube文件了吧？

snljty2 · 发表于 Post on 2023-1-4 20:27:29

KSeGaSn 发表于 2023-1-4 20:19
请教各位老师，我在Gaussian结合TDDFT计算激发态，想要研究分子S1/T1/T2等激发态的弛豫结构的前线轨道特征 ...

不是，fch不会存“激发态（自然）轨道”，只有激发态弛豫密度的密度矩阵。还需要一些操作，认真看卢老师博文《在Multiwfn中基于fch产生自然轨道的方法与激发态波函数、自旋自然轨道分析实例》。

KSeGaSn · 发表于 Post on 2023-1-4 20:31:08

snljty2 发表于 2023-1-4 20:27
不是，fch不会存“激发态（自然）轨道”，只有激发态弛豫密度的密度矩阵。还需要一些操作，认真看卢老师 ...

明白了！需要进入Multiwfn 200→16→CI，重新存储一个真正载有S1态波函数信息的文件对吧？谢谢您的回复！

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