简单量子化学问题答疑专帖

奶啵啵 · 发表于 Post on 2023-1-7 20:10:44

老师，想问一个问题，一个体系在高斯用的PBE0进行的计算，没有版权。准备转用ORCA ,数据不想重新算，可以说用ORCA得到的结果么？

Hulk · 发表于 Post on 2023-1-7 22:47:35

谢谢zjxitcc老兄的扫盲，sob老师的分享。我研读了之前的帖子，sob老师说优化M06-2X/def-TZVP，单点M06-2X/def2-TZVPP，就不会有什么问题。我这里直接改成UM06-2X就可以了吗？如果是计算自由基阳离子，那么是不是电荷改成1，自旋多重度改成2？

Hulk · 发表于 Post on 2023-1-7 22:58:32

@zjxitcc 不知道为啥运行不了

Hulk · 发表于 Post on 2023-1-7 22:59:29

本帖最后由 Hulk 于 2023-1-7 23:04 编辑

请大家挑挑毛病

chands · 发表于 Post on 2023-1-7 23:26:22

Hulk 发表于 2023-1-7 22:59
请大家挑挑毛病

um06-2x改为m062x，不需要加短横，普通的单重态体系不需要加u。
def-tzvp改为tzvp

sobereva · 发表于 Post on 2023-1-8 05:46:02

奶啵啵发表于 2023-1-7 20:10
老师，想问一个问题，一个体系在高斯用的PBE0进行的计算，没有版权。准备转用ORCA ,数据不想重新算，可以说 ...

“原则上”不能

sobereva · 发表于 Post on 2023-1-8 05:46:36

Hulk 发表于 2023-1-7 22:59
请大家挑挑毛病

不要24小时内在思想家公社QQ群和计算化学公社论坛里问同一问题，注意看群文件里群规，以及论坛置顶的论坛新社员必读贴

你在群里明明问过

下次再这样扣分处理

wjc404 · 发表于 Post on 2023-1-8 10:58:47

奶啵啵发表于 2023-1-7 20:10
老师，想问一个问题，一个体系在高斯用的PBE0进行的计算，没有版权。准备转用ORCA ,数据不想重新算，可以说 ...

如果是要发表的文章，或者学位论文，还是慎重为好。万一人家重复不出来，上纲上线，就不好交代了。
再说ORCA不都有RI加速吗，计算没准比Gaussian更快呀。

lurensan · 发表于 Post on 2023-1-8 13:04:46

各位老师好，这篇文章是不是使用M06L-D3/6-31G*优化气态结构，然后在SMD模型，TFE为溶剂的情况下同样使用M06L-D3/6-31G*计算单点能？
这样计算能量的基组是不是有点小？
中心原子是Ni，计算时不用赝势基组是不是有点不太合适？
如果我想重复该反应路径，使用M06L-D3/genecp，CHON使用6-31G*，Ni使用SDD优化气态结构，在SMD模型，TFE为溶剂的情况下使用M06L-D3/def2tzvp计算能量可以吗？
或者使用M06L-D3/deftzvp优化结构，在SMD模型，TFE为溶剂的情况下使用M06L-D3/def2tzvp计算能量是不是合理呢？

zjxitcc · 发表于 Post on 2023-1-8 15:58:06

奶啵啵发表于 2023-1-7 20:10
老师，想问一个问题，一个体系在高斯用的PBE0进行的计算，没有版权。准备转用ORCA ,数据不想重新算，可以说 ...

绝对是不可以的。用ORCA读取高斯的结果（例如坐标、轨道等信息）算一下，顶多一两天时间，不可偷懒。如果你觉得难，那估计你是想在ORCA里从零算起。

zjxitcc · 发表于 Post on 2023-1-8 16:00:31

Hulk 发表于 2023-1-7 22:59
请大家挑挑毛病

除了305层提到的问题外，你给的内存太抠了，才给1GB，机器内存允许条件下，至少给10GB。

奶啵啵 · 发表于 Post on 2023-1-8 16:17:32

sobereva 发表于 2023-1-8 05:46
“原则上”不能

那万一审稿人要坐标信息啥的，我不就gg ,hahha

奶啵啵 · 发表于 Post on 2023-1-8 16:18:58

zjxitcc 发表于 2023-1-8 15:58
绝对是不可以的。用ORCA读取高斯的结果（例如坐标、轨道等信息）算一下，顶多一两天时间，不可偷懒。如果 ...

原来如此，因为学了一段时间高斯，才接触orca

zjxitcc · 发表于 Post on 2023-1-8 16:24:19

lurensan 发表于 2023-1-8 13:04
各位老师好，这篇文章是不是使用M06L-D3/6-31G*优化气态结构，然后在SMD模型，TFE为溶剂的情况下同样使用 ...

若仅从截图内容看，是的。
是的。
Ni没有说非得要赝势基组。C、N、O原子用6-31G*倒没啥；这里面涉及氢转移，最好给氢原子加上极化函数，例如使用6-31G(d,p)；Ni用SDD或def2-TZVP更好，前者对Ni有赝势，后者对Ni是全电子基组，再不济至少得def-TZVP。
当你研究的反应中重要步骤的过渡态、中间体等结构受溶剂影响较小才行。如果不满足，应该在结构优化、找过渡态时就考虑隐式溶剂模型。

zjxitcc · 发表于 Post on 2023-1-8 16:26:14

奶啵啵发表于 2023-1-8 16:17
那万一审稿人要坐标信息啥的，我不就gg ,hahha

坐标与程序无关。问到详细计算细节时容易露馅（例如有的功能某程序根本没有，一问你就被拆穿了）

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

浏览过的版块