简单量子化学问题答疑专帖

11111111m · 发表于 Post on 2023-1-16 19:12:28

wzkchem5 发表于 2023-1-16 19:02
如果你要研究一大批分子的话，我觉得这些分子肯定有一些共同的地方吧，比如主体部分是相同的，只是取代基 ...

结构不相似，只是都是TADF材料这种。数据库下载的话，是直接有初始坐标可以作为高斯的输入文件吗？

奶啵啵 · 发表于 Post on 2023-1-16 19:44:59

奶啵啵发表于 2023-1-16 18:57
(1)有这个文件
（2）确实，设置单核可以计算，看来是并行问题，用的版本5.0.2，MMPI也是安装在了默认位 ...

已解决

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-1-16 20:09:40

11111111m 发表于 2023-1-16 12:12
结构不相似，只是都是TADF材料这种。数据库下载的话，是直接有初始坐标可以作为高斯的输入文件吗？

要么直接能下到高斯的输入文件，要么能下到坐标，经过简单的复制粘贴或者从某些软件里转一下格式可以得到高斯的输入文件

11111111m · 发表于 Post on 2023-1-16 21:40:45

wzkchem5 发表于 2023-1-16 20:09
要么直接能下到高斯的输入文件，要么能下到坐标，经过简单的复制粘贴或者从某些软件里转一下格式可以得到 ...

好的，谢谢老师

sobereva · 发表于 Post on 2023-1-17 05:34:20

11111111m 发表于 2023-1-16 18:53
各位老师想请教下，一两百个原子体系的初始结构只能通过gaussview或者chemdraw画嘛，因为做的分子比较多感 ...

完全要看具体什么体系。决定适用的程序的从来不是原子数

常见的有机体系，以及未经额外修饰的相对知名的母体结构，在chemspider、pubchem上都能搜索到，可以直接下载结构省得自己从头画，但要自行判断合理性

如果是理论计算文章里研究的TADF，近些年的较好物理化学类的期刊上的文章多半都会在SI里给出优化后的笛卡尔坐标，可以直接复制到gjf里。

11111111m · 发表于 Post on 2023-1-17 18:46:40

请教下老师们，刚安装的Gaussian09，用水分子的hf测试了一下，一直卡在这里，同样的输入文件自己的电脑几秒钟就完事了，这是什么情况

chands · 发表于 Post on 2023-1-17 19:11:33

11111111m 发表于 2023-1-17 18:46
请教下老师们，刚安装的Gaussian09，用水分子的hf测试了一下，一直卡在这里，同样的输入文件自己的电脑几秒 ...

上输入输出文件。

ABetaCarw · 发表于 Post on 2023-1-19 03:27:46

社长好，我在计算研究某分子时候，发现其无磷光发射，在修饰某取代基后，有磷光发射。现在审稿人要从电子结构上面去分析，这个可以从什么角度去分析？我目前只能计算考虑了SOC的振子强度，以及S0与T1之间的SOC，但是电子结构怎么分析，我脑袋空空的。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-1-19 04:51:14

ABetaCarw 发表于 2023-1-18 20:27
社长好，我在计算研究某分子时候，发现其无磷光发射，在修饰某取代基后，有磷光发射。现在审稿人要从电子结 ...

首先一个问题，你说的有没有磷光发射是纯从计算上得出来的结论吗？是计算了量子产率还是只看了振子强度？有没有考虑Herzberg-Teller效应？
假设这个体系符合Kasha规则，那么没有磷光发射的可能原因包括（1）T1->S0磷光发射太慢了（或者说SOC校正后的振子强度太小了）；（2）T1->S0 ISC太快了，也就是T1全都非辐射弛豫掉了；（3）T1->S1 RISC和S1->S0荧光发射太快了，也就是这个体系走的是TADF途径；（4）T1量子产率太低了；等等。其中（1）又分（1a）T1-Sn SOC太小了、（1b）Sn->S0振子强度太小了、（1c）T1-Sn gap太大了等等可能原因。进一步地，（1a）又分成因为El-Sayed规则导致SOC小、因为轨道重叠太小导致SOC小、因为涉及的原子太轻导致SOC小等等可能原因；（1b）又分成因为轨道重叠太小导致振子强度小、因为轨道对称性不匹配导致振子强度小等等。
总之解释有没有磷光发射是一个极其复杂的决策树，以上我把这个决策树的一些主要的分支提了一下，虽然未必完全解决你的问题，但是起码你知道一开始应该怎么做了

sobereva · 发表于 Post on 2023-1-19 08:02:23

11111111m 发表于 2023-1-17 18:46
请教下老师们，刚安装的Gaussian09，用水分子的hf测试了一下，一直卡在这里，同样的输入文件自己的电脑几秒 ...

看下文
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439（http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html）

有些人在运行Windows版Gaussian时明明输入文件正确，计算任务计算量也很小，却在中途莫名其妙地卡住、出现莫名其妙的报错，这往往是因为机子里的360等垃圾山寨安全程序捣的鬼。把这些垃圾程序删掉往往就能解决。另外，笔者发现XEON v3（对于v4等其它型号可能也有）系列的一些CPU运行win32版Gaussian09/16时会失败，这应当是CPU和程序兼容性的原因，目前没有发现好办法解决（不过这不是什么大问题，一般也不会有人用几十核的服务器去跑win32版Gaussian）。

Yjc · 发表于 Post on 2023-1-19 13:36:59

请问各位老师，利用热力学组合方法算出来的结果中，G4(0K)和G4 Energy中的数值有何不同？可不可以理解为前者代表的是0K下的内能，而后者是当前温度下的内能？谢谢各位老师解答！

ABetaCarw · 发表于 Post on 2023-1-19 16:08:45

wzkchem5 发表于 2023-1-19 04:51
首先一个问题，你说的有没有磷光发射是纯从计算上得出来的结论吗？是计算了量子产率还是只看了振子强度？ ...

感谢王博如此详细全面的回答，这个确实给我以后研究这类问题指明了方向

ABetaCarw · 发表于 Post on 2023-1-19 16:58:55

wzkchem5 发表于 2023-1-19 04:51
首先一个问题，你说的有没有磷光发射是纯从计算上得出来的结论吗？是计算了量子产率还是只看了振子强度？ ...

王博，“（1b）Sn->S0振子强度太小了” 这个我不是很理解，为何Sn的振子强度太小会让磷光发射变得困难？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-1-19 17:49:02

本帖最后由 wzkchem5 于 2023-1-19 11:11 编辑

ABetaCarw 发表于 2023-1-19 09:58
王博，“（1b）Sn->S0振子强度太小了” 这个我不是很理解，为何Sn的振子强度太小会让磷光发射变得困难？

因为T1->S0之所以有振子强度，是因为SOC使得T1有少许Sn（n>0）的成分。但假如那些和T1有明显混合的单重态激发态到S0的振子强度也很小（例如因为对称性不匹配或轨道重叠太小等原因）的话，那么即便SOC大，T1->S0的振子强度也会比较小。
当然，T1->S0有振子强度的另一个原因是SOC使得S0有少许Tn（n>1）的成分，但因为一般有机分子的S0-T2 gap比S1-T1 gap大得多，S0混入Tn对振子强度的贡献应该是次要的。

ABetaCarw · 发表于 Post on 2023-1-19 19:15:36

wzkchem5 发表于 2023-1-19 17:49
因为T1->S0之所以有振子强度，是因为SOC使得T1有少许Sn（n>0）的成分。但假如那些和T1有明显混合的单重态 ...

谢谢，这下我清晰多了

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