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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2015-4-18 18:58:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-4-18 05:14
静态相关强是由于近简并产生的,这样的体系没法用单个行列式定性正确的描述(即按aufbau定理从低到高排那 ...

谢谢 sob sennsei
可以这样理解吗?:过渡金属体系的df轨道简并导致了波函数方法需要引入多参考态,过渡金属的强电子局域话导致密度泛函方法需要引入强关联体系的dft+u,只是一种体系的两个方面。而静态相关强的体系和强关联电子体系概念本身没有什么必然包含关系。
本周目已沉沦,下个世界再会

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-4-19 01:27:07 | 只看该作者 Only view this author
zhanfei 发表于 2015-4-18 18:58
谢谢 sob sennsei
可以这样理解吗?:过渡金属体系的df轨道简并导致了波函数方法需要引入多参考态,过渡 ...

可以这么说
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2015-4-19 08:19:49 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 卡开发发 于 2015-5-26 12:14 编辑
zhanfei 发表于 2015-4-18 18:58
谢谢 sob sennsei
可以这样理解吗?:过渡金属体系的df轨道简并导致了波函数方法需要引入多参考态,过渡 ...

这个问题其实非常有趣,甚至单独开个帖子讨论也不为过。依我浅薄的理解,我觉得+U接近于动态关联的校正。原理上笼统点说,应该是通过两个电子靠近时产生进行能量惩罚(虽然不是直接限定两个电子靠近的几率),从而修正占据数和占据带的本征值。
日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。不做培*,不接代*,不接*发谢谢。

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发表于 Post on 2015-4-21 13:36:00 | 只看该作者 Only view this author
请教各位老师,如果想计算苯并噻吩和银离子的相互作用,应该选择什么方法和基组?能采用b3lyp/aug-cc-pvdz-pp这个组合吗?我在谷歌学术里搜了一下发现采用这个组合的文章似乎很少,困惑中。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-4-21 18:03:03 | 只看该作者 Only view this author
vigaryang 发表于 2015-4-21 13:36
请教各位老师,如果想计算苯并噻吩和银离子的相互作用,应该选择什么方法和基组?能采用b3lyp/aug-cc-pvdz- ...

可以。
但根据目前的大形势,还是建议加上DFT-D3校正
由于体系并不大,用双杂化泛函会更好些
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2015-4-21 19:11:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-4-21 18:03
可以。
但根据目前的大形势,还是建议加上DFT-D3校正
由于体系并不大,用双杂化泛函会更好些

好的,谢谢sob老师!

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发表于 Post on 2015-4-23 15:00:47 | 只看该作者 Only view this author
我想保存NBO轨道信息到chk文件中,计算时却出现以下错误,百思不得其解,请教一下是怎么回事, 谢谢!
******************************************
Gaussian 09:  ES64L-G09RevD.01 24-Apr-2013
                23-Apr-2015
******************************************
%nprocshared=6
Will use up to    6 processors via shared memory.
%mem=1GB
%chk=bbsf-Ag.chk
---------------------------------------------------
#p b3lyp/aug-cc-pvdz-pp pop=(NBOread,SaveNBOs) test
---------------------------------------------------
QPErr --- An ambiguous keyword was detected.
#p b3lyp/aug-cc-pvdz-pp pop=(NBOread,Sav

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-4-23 15:03:45 | 只看该作者 Only view this author
vigaryang 发表于 2015-4-23 15:00
我想保存NBO轨道信息到chk文件中,计算时却出现以下错误,百思不得其解,请教一下是怎么回事, 谢谢!
*** ...

aug-cc-pvdz-pp不是内置的赝势基组,需要从EMSL上获得。
test关键词没意义。
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发表于 Post on 2015-4-23 15:05:25 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 vigaryang 于 2015-4-23 15:14 编辑
sobereva 发表于 2015-4-23 15:03
aug-cc-pvdz-pp不是内置的赝势基组,需要从EMSL上获得。
test关键词没意义。

谢谢!那能否麻烦您推荐一个内置的赝势基组,适用于计算Ag离子的呢?能用LanL2DZ么?看了下指南,LanL2DZ的元素范围似乎涵盖了Ag。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-4-23 15:39:56 | 只看该作者 Only view this author
vigaryang 发表于 2015-4-23 15:05
谢谢!那能否麻烦您推荐一个内置的赝势基组,适用于计算Ag离子的呢?能用LanL2DZ么?看了下指南,LanL2DZ ...

可以用Lanl2DZ或者SDD(后者更大但结果一般更好点)
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发表于 Post on 2015-4-23 15:50:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-4-23 15:39
可以用Lanl2DZ或者SDD(后者更大但结果一般更好点)

好的,谢谢

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发表于 Post on 2015-4-24 16:28:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-2-25 20:16
def2-SVP大小和6-31G**相仿佛,但结果更好。在高斯中,由于def2-SVP没有利用SP壳层,所以耗时比6-31G**会 ...

那BP86,PW91,BLYP, PBE等泛函都在什么条件下适用呢?比如过渡金属和主族元素构成的合金,应该选什么?和体系大小有关系么?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-4-24 17:33:13 | 只看该作者 Only view this author
jlx_ 发表于 2015-4-24 16:28
那BP86,PW91,BLYP, PBE等泛函都在什么条件下适用呢?比如过渡金属和主族元素构成的合金,应该选什么?和 ...

泛函选用见此贴http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=536
你提到的都是纯泛函,对于量化计算,如今纯泛函只有两种情况有使用价值:1 静态相关明显的时候 2 想利用密度拟合技术加快计算速度,此时速度比B3LYP等杂化泛函可以快一个数量级,详见《大体系弱相互作用计算的解决之道》(http://hi.baidu.com/sobereva/item/3cbf8904defdc4803d42e2e9
PW91没任何好处,一般不用。BP86、BLYP半斤八两。PBE搞第一性原理的人爱用。
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发表于 Post on 2015-4-24 18:04:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-4-24 17:33
泛函选用见此贴http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=536
你提到的都是纯泛函,对于量 ...


谢谢Sob大神,顿时有种豁然开朗的感觉,不用在纠结看综述选哪个好...
因为现在初学嘛,用的是MS,学的还是Dmol3模块,早知道用castep模块了,它下面倒是有B3LYP...但是用的三千块的笔记本,速度上...哎,都是泪

大神,还有个问题想要请教http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=998

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-4-24 18:09:28 | 只看该作者 Only view this author
jlx_ 发表于 2015-4-24 18:04
谢谢Sob大神,顿时有种豁然开朗的感觉,不用在纠结看综述选哪个好...
因为现在初学嘛,用的是MS,学的 ...

后来的MS里的dmol3也有b3lyp,只不过速度比起纯泛函慢得多得多,不知MS8.0是否有改进
CASTEP还是很容易上手的,看看教程几天就会了
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