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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2015-6-1 08:44:23 | 只看该作者 Only view this author
之前一直做的是中性分子的计算,现在要算一个铵盐(一个共轭大分子的伯胺的溴化盐)的前线轨道,不知道在GV里面怎么画这个铵盐。另外,看文献,优化铵盐的泛函各有不同,此类分子的优化的泛函基组使用有什么注意事项。谢谢老师!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-6-1 09:36:06 | 只看该作者 Only view this author
primashen 发表于 2015-6-1 08:44
之前一直做的是中性分子的计算,现在要算一个铵盐(一个共轭大分子的伯胺的溴化盐)的前线轨道,不知道在GV ...

和计算普通分子一样,没什么特殊的。常用的B3LYP就没问题。
结构式是什么样就按照什么样去画就行了。
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发表于 Post on 2015-6-2 11:04:09 | 只看该作者 Only view this author
请问我的输入有问题吗,计算老是出错,谢谢

#P OPT QCISD(T)/6-311+G(d,p)//MP2/6-311+G(d,p)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-6-2 11:33:24 | 只看该作者 Only view this author
diaolanxinyu 发表于 2015-6-2 11:04
请问我的输入有问题吗,计算老是出错,谢谢

#P OPT QCISD(T)/6-311+G(d,p)//MP2/6-311+G(d,p)


QCISD(T)没有解析梯度,被优化的变量必须明确写成变量形式
虽然你的输入里QCISD(T)只做单点,但是高斯还是错误地假定当成QCISD(T)要做优化而做一下检验。
优化和单点计算分成两个任务写即可。
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发表于 Post on 2015-6-2 18:18:35 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师,已成功解决!

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发表于 Post on 2015-6-3 19:01:22 | 只看该作者 Only view this author
请问Sob老师,过渡态做完并且已通过IRC确定过反应物和生成物,得到两个不同途径的能垒为<5kcal/mol和9kcal/mol,我可以说前者是比较快的反应而后者在动力学上会比较慢么?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-6-3 19:44:56 | 只看该作者 Only view this author
ccnujuan 发表于 2015-6-3 19:01
请问Sob老师,过渡态做完并且已通过IRC确定过反应物和生成物,得到两个不同途径的能垒为

可以
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发表于 Post on 2015-6-3 19:51:20 | 只看该作者 Only view this author

再请问Sob老师,对应这两个反应活化能(<5kcal/mol和9kcal/mol)的反应速率一般处于什么水平呢?是非常快还是一般的速率?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-6-3 20:41:34 | 只看该作者 Only view this author
ccnujuan 发表于 2015-6-3 19:51
再请问Sob老师,对应这两个反应活化能(

前者相对算是快的,后者一般
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发表于 Post on 2015-6-3 20:48:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-6-3 20:41
前者相对算是快的,后者一般

谢谢Sob老师~

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发表于 Post on 2015-6-5 15:27:52 | 只看该作者 Only view this author
我想模拟下 一个银晶体表面吸附了水和氢离子之后的能量变化 因为ms计算晶面能总是失败

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发表于 Post on 2015-6-5 17:42:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-6-3 20:41
前者相对算是快的,后者一般

我觉得 对于化学反应来说,9kcal/mol 的反应速度也非常快了

环己烷的构象翻转势垒都有11kcal/mol 左右

当然快慢只是个相对的概念,还是要看评判的标准是什么?

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第一原理惨品小作坊

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发表于 Post on 2015-6-5 17:48:36 | 只看该作者 Only view this author
五十八 发表于 2015-6-5 15:27
我想模拟下 一个银晶体表面吸附了水和氢离子之后的能量变化 因为ms计算晶面能总是失败

把相应的计算参数等发来看看,还有结果文件
日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。
本周忙

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发表于 Post on 2015-6-8 12:44:44 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2015-6-5 17:48
把相应的计算参数等发来看看,还有结果文件

啊啊啊 解决了 是forcefield选的不对

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发表于 Post on 2015-6-11 15:22:27 | 只看该作者 Only view this author
今天才看到这个帖子,以后就不用常常发帖问了。

今天发的这个帖子应该在回复就行了,不该发帖的。http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=1259

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