简单量子化学问题答疑专帖（旧版，已关帖）

ccnujuan · 发表于 Post on 2015-6-11 20:36:40

请问Sob老师，化学反应的吉布斯自由能为9.3kcal/mol的话（B3LYP/6-31g++(d,p)），在热力学上是可行的么？我们记得物理化学上的判据是<0为自发，这个数值是说明反应在热力学上受阻么？

sobereva · 发表于 Post on 2015-6-11 21:56:46

ccnujuan 发表于 2015-6-11 20:36
请问Sob老师，化学反应的吉布斯自由能为9.3kcal/mol的话（B3LYP/6-31g++(d,p)），在热力学上是可行的么？我 ...

只是个比例问题。你用deltaG=-RTLnK就能算出热平衡下产物和反应物的比例K是多少。

fankui1990129 · 发表于 Post on 2015-6-12 21:08:00

请问SP，#p和#T分别是什么意思？

sobereva · 发表于 Post on 2015-6-12 21:50:59

fankui1990129 发表于 2015-6-12 21:08
请问SP，#p和#T分别是什么意思？

SP就是做单点，这个不用写，默认就是单点任务。
#P是输出运算过程中详细信息，#T只输出较重要的信息（T=Terse）。默认是#N，输出中等的信息量。

fankui1990129 · 发表于 Post on 2015-6-14 09:33:09

“比如想在高精度下优化一个范德华复合物，事先用诸如B3LYP这种根本没法合理描述色散作用的泛函预优化不仅白费时间，预优化出的结构还很可能比你最初搭的结构偏离极小点结构更多。”

sob老师，您在文章中提到这么一句。我在优化一个模型的时候用的就是B3LP，这个模型时两个反应物在一起的复合物，请问这个时候用B3LP优化可以么？

sobereva · 发表于 Post on 2015-6-14 20:03:12

fankui1990129 发表于 2015-6-14 09:33
“比如想在高精度下优化一个范德华复合物，事先用诸如B3LYP这种根本没法合理描述色散作用的泛函预优化不仅 ...

看形成复合物是由哪类弱相互作用导致的。如果静电成分大，比如氢键复合物，那B3LYP优化出的结构还能用。如果是色散作用主导的，比如两个烷烃的范德华二聚体、两个苯的pi-pi堆积等，优化出来的结构完全不能用

fankui1990129 · 发表于 Post on 2015-6-15 16:01:03

本帖最后由 fankui1990129 于 2015-6-15 21:53 编辑

sob老师您好，请问单点能的物理意义是？和内能，吉布斯生成能等有何区别呢

北极天99 · 发表于 Post on 2015-6-15 21:25:48

一直看到有文献有的计算出来了HOMO-1，HOMO-2的值，求指点从输出文件里找哪些信息，然后怎么计算的啊？谢谢！

superrice · 发表于 Post on 2015-6-15 22:04:38

SOB老师，请问一般量化计算是双电子积分比较耗时还是要看具体的方法？

sobereva · 发表于 Post on 2015-6-15 22:22:52

superrice 发表于 2015-6-15 22:04
SOB老师，请问一般量化计算是双电子积分比较耗时还是要看具体的方法？

对于HF/DFT，耗时主要是在计算双电子积分上，因此计算量和高斯函数数目最直接。
但对于后HF方法，一方面耗时来自于AO->MO积分变换，另一方面就是基于根据具体的方法做大量复杂的涉及MO积分的运算，相对来说计算双电子积分的耗时倒是微不足道了。

sobereva · 发表于 Post on 2015-6-15 22:32:11

北极天99 发表于 2015-6-15 21:25
一直看到有文献有的计算出来了HOMO-1，HOMO-2的值，求指点从输出文件里找哪些信息，然后怎么计算的啊？谢谢 ...

比如输出文件可看见
Alpha occ. eigenvalues -- -19.21555 -1.14583 -0.59075 -0.44329 -0.34768
occ代表占据轨道，能量从低往高排，最高的-0.34768 a.u.就是HOMO能量，-0.44329就是HOMO-1，-0.59075就是HOMO-2

北极天99 · 发表于 Post on 2015-6-17 21:33:53

请问sob老师，一个物质的解离过程，中间经过过渡态，会不会在过渡态后直接解离，而没有经过一个中间体过程？

sobereva · 发表于 Post on 2015-6-17 21:45:07

北极天99 发表于 2015-6-17 21:33
请问sob老师，一个物质的解离过程，中间经过过渡态，会不会在过渡态后直接解离，而没有经过一个中间体过程 ...

也有可能，但往往还是会经历一个解离产物的复合物的过程

huanyizhen · 发表于 Post on 2015-6-18 17:10:43

老师您好：我想知道两分子弱相互作用的主导是静电还是色散（肽的sheet结构，应该是静定主导）。已经用m062x/6-31g*优化了结构，且用m062x/6-311+g*+cp校正求出了相互作用能。因为体系太大不能做能量分解，所以想用dftd3这个程序来计算一下分子间的色散能，比较已经求出的相互作用能和色散能之间大小关系，来判断是静电主导还是色散主导。我的问题是：1、这个判断思路正确吗？ 2、用dftd3计算色散时，所用的泛函应该是m062x还是其它的？ 3、假设相互作用能为-100kJ/mol，那么色散能在数值上大于多少时，可以说是静电完全占主导作用？麻烦您了

sobereva · 发表于 Post on 2015-6-18 21:44:22

huanyizhen 发表于 2015-6-18 17:10
老师您好：我想知道两分子弱相互作用的主导是静电还是色散（肽的sheet结构，应该是静定主导）。已经用m062x ...

用DFT-D3得到色散能必须用那些完全不能描述色散的泛函，比如B3LYP比较合适。M062X肯定不行，自己已经能不错地描述色散了。
光靠DFT-D3还不足以比较色散和静电作用。因为B3LYP相互作用能本身包含了静电、极化、交换互斥，还得进一步分解才能讨论。
你的体系，我建议直接基于分子力场来分解，比较省事。LJ势的12部分是交换互斥，6的部分是色散吸引，静电作用就是基于原子电荷计算出来的。

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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖（旧版，已关帖）

高斯计算中有关HOMO的问题