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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2022-2-3 23:25:48 | 只看该作者 Only view this author
wy标点人生 发表于 2022-2-3 15:41
虚频在SCI论文中应该怎么写呢?我有看到单位是i/cm,但是有老师说应该是i 1/cm,希望老师能帮我解答一下!

最正规的写法:350i cm-1(-1上标,下同),如果在表格里,应该在单元格里写350i、表头/表题/表注里写单位是cm-1,不能在单元格里写350、单位写i cm-1(也就是那个i不是单位的一部分,而是数字的一部分)。
/cm等价于cm-1,但是不如cm-1正规,有的审稿人可能会说/cm是错误的写法。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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争取学好计算化学!

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发表于 Post on 2022-2-4 13:47:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-2-3 23:25
最正规的写法:350i cm-1(-1上标,下同),如果在表格里,应该在单元格里写350i、表头/表题/表注里写单 ...

嗯嗯,非常感谢老师的解答!!
始终相信生活美好,万物可爱!

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发表于 Post on 2022-2-4 18:12:55 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,三角双锥的硅烷,硅的杂化状态是dsp3还是sp3d呀?

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发表于 Post on 2022-2-4 20:54:41 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2022-2-4 11:12
sob老师您好,三角双锥的硅烷,硅的杂化状态是dsp3还是sp3d呀?

sp3d,因为这里涉及的d轨道是3d,s、p是3s、3p,d轨道比s、p高,所以写在后面。
不过这种hypervalent体系用sp3d描述不是太准确,也有很大程度的三中心四电子键成分在里面,所以sp3d应该理解为一个很粗糙的近似,真实成键方式是不能用单一的杂化方式描述的。
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-5 04:43:18 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2022-2-4 18:12
sob老师您好,三角双锥的硅烷,硅的杂化状态是dsp3还是sp3d呀?

硅烷怎么是三角双锥的,贴个图
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2022-2-5 08:57:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-2-5 04:43
硅烷怎么是三角双锥的,贴个图

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2022-2-5 08:58:48 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-2-4 20:54
sp3d,因为这里涉及的d轨道是3d,s、p是3s、3p,d轨道比s、p高,所以写在后面。
不过这种hypervalent体 ...

谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-5 21:35:34 | 只看该作者 Only view this author

这明显不叫硅烷
可以对P做个布居分析看实际电子结构(各个原子轨道壳层布居数)是什么样的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-2-6 15:19:02 | 只看该作者 Only view this author
老师们好,请问量子化学和第一性原理是个什么关系呢?量化程序和第一性原理程序的作用区别很大吗?

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发表于 Post on 2022-2-6 17:21:43 | 只看该作者 Only view this author
有什么推荐的方法准确快速计算化合物的生成焓

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发表于 Post on 2022-2-6 18:00:01 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2022-2-6 10:21
有什么推荐的方法准确快速计算化合物的生成焓

快速就不可能准确,准确就不可能快速。所以你必须得告诉我们你具体要求多准、多快,我们才能推荐。
不仅是量子化学领域,但凡是让别人推荐什么东西,都是这个道理,你上来就问“有没有性能又好又便宜的”,别人怎么给你推荐?你必须要么给出预算,别人给你推荐这个预算以内的性能最好的产品;要么给出你至少需要多少性能,别人给你推荐性能比这个好的最便宜的产品。放在这里也是一样,你要么给出预算(比如100个原子的体系用8个核必须在一天内算完),要么给出最低性能(比如要求生成焓准确到1kcal/mol每原子),我们才可能给你推荐。
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2022-2-6 18:03:16 | 只看该作者 Only view this author
negligible 发表于 2022-2-6 08:19
老师们好,请问量子化学和第一性原理是个什么关系呢?量化程序和第一性原理程序的作用区别很大吗?

数学基础层面上是一码事,但是前者主要是做化学的人研究的,用来算分子等孤立体系;后者主要是做物理的人研究的,用来算周期性体系。所以虽然数学内核一样,但是涉及的专业术语、程序,以及实际计算中需要注意的地方都很不一样。
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2022-2-6 19:34:47 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-2-6 18:00
快速就不可能准确,准确就不可能快速。所以你必须得告诉我们你具体要求多准、多快,我们才能推荐。
不仅 ...

我们还是比较灵活的,有些数量多,精度要求不高的希望快点,20个CNO,24核希望2天左右算完
需要精度高的,同样体系,48核,希望2周左右算完

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-7 01:39:46 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2022-2-6 19:34
我们还是比较灵活的,有些数量多,精度要求不高的希望快点,20个CNO,24核希望2天左右算完
需要精度高的 ...
精度要求高的,B3LYP-D3(BJ)/def2-TZVP做优化和振动分析,DLPNO-CCSD(T) with tightPNO / cc-pVQZ算高精度单点。最后按下文做法算焓,和标准物质的求差得到生成焓
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html

精度要求不高的,B3LYP-D3(BJ)/def-TZVP优化和振动分析,revDSD-PBEP86-D3(BJ)/def2-QZVPP算高精度单点。

相关理论方法简介看
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学程序的输入文件的功能
http://sobereva.com/490http://bbs.keinsci.com/thread-13560-1-1.html

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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2022-2-7 09:25:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-2-5 21:35
这明显不叫硅烷
可以对P做个布居分析看实际电子结构(各个原子轨道壳层布居数)是什么样的

sob老师您好,您指的是NBO布局分析还是muliken布局分析呀?您所指的布局分析可以用multiwfn做吗?

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