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求助粗粒度分子动力学模拟中CO2与不同珠子间的非键相互作用势能参数 分子模拟 (Molecular Modeling) 郭晨晨 2024-11-19 00 郭晨晨 2024-11-19 16:58
为什么用户组Level 6在介绍中显示发帖受限制？attach_img agree 公社大厅 (Commune Hall) 露娜sama 2024-11-19 749 sobereva 7 day ago
想问一下我想在高斯手册中找丙三醇对应的英文名称进行计算，应该怎么找呢 量子化学 (Quantum Chemistry) 勇往直前 2024-11-19 215 勇往直前 2024-11-19 17:28
求助：各位老师，多条链蛋白进行RMSD分析时，应该怎样指定残基attach_img 分子模拟 (Molecular Modeling) teacher7 2024-11-19 00 teacher7 2024-11-19 16:10
求助在MS中进行水的MSD计算得到的log（MSD）和log（t）的线性关系斜率偏离1很大 分子模拟 (Molecular Modeling) qixueyuan 2024-11-19 00 qixueyuan 2024-11-19 15:54
某几个二面角随模拟时间的变化如何计算attach_img 分子模拟 (Molecular Modeling) Sunca 2024-11-19 460 sobereva 6 day ago
活性空间的选取对能量有影响吗attach_img 量子化学 (Quantum Chemistry) haowangshu 2024-11-19 447 haowangshu 7 day ago
Gaussian使用FCHT输出Huang-Rhys因子求助 量子化学 (Quantum Chemistry) adreamy 2024-11-19 227 adreamy 2024-11-19 18:43
求助用vmd分析水中的氢键时每个水分子的氢键数与文献有差距attach_img 分子模拟 (Molecular Modeling) whyu 2024-11-19 668 whyu 7 day ago
请教下大家极化子该如何建模呢？谢谢大家attach_img 第一性原理 (First Principle) zhaojingjing 2024-11-19 00 zhaojingjing 2024-11-19 11:36
声子谱中的 k 点问题 第一性原理 (First Principle) 吃巧克力的桃子 2024-11-19 365 乐平 3 hour ago
问题已解决—盐水溶液体系的MD模拟，温度失控attach_img 第一性原理 (First Principle) sim 2024-11-19 753 sim 7 day ago
Material Studio建AC盒子，聚合物链扭曲成团且不在盒子中心怎么办 分子模拟 (Molecular Modeling) yaoyaoleyao 2024-11-19 00 yaoyaoleyao 2024-11-19 10:50
DPGEN训练集准备、训练参数的相关问题attach_img 分子模拟 (Molecular Modeling) Alset 2024-11-19 00 Alset 2024-11-19 10:42
使用EOM-DLPNO-CCSD方法计算时报错ORCA finished by error termination in MDCIattach_img 量子化学 (Quantum Chemistry) 于铮 2024-11-19 574 于铮 前天 08:56
DP-Gen训练中FP步骤计算单点能不收敛的问题attach_img 第一性原理 (First Principle) liweiiqi 2024-11-19 00 liweiiqi 2024-11-19 09:34
如何让 VMD 批量读入 .xyz 文件并计算 SASA？ 分子模拟 (Molecular Modeling) Tifo 2024-11-19 345 sobereva 7 day ago
orca联用NBO7.0报错attach_img 量子化学 (Quantum Chemistry) Boer 2024-11-19 562 Boer 7 day ago
请教各位老师，如何计算双层材料层间的电荷转移的数值大小 第一性原理 (First Principle) sansui 2024-11-18 219 sobereva 2024-11-19 08:51
如何得到糖链的糖苷键二面角自由能景观图attach_img 分子模拟 (Molecular Modeling) Sunca 2024-11-18 00 Sunca 2024-11-18 22:12
含非标准残基蛋白使用pdb2gmx转换结构后，螺旋结构消失，该如何解决？attach_img 分子模拟 (Molecular Modeling) mtpeng 2024-11-18 217 mtpeng 2024-11-19 08:31
求助固态电解质和电极点接触和面接触的不同建模attach_img 第一性原理 (First Principle) yiangcl 2024-11-18 532 yiangcl 2024-11-19 16:49
protein plus计算口袋体积问题-只能显示一个底物attach_img 分子模拟 (Molecular Modeling) s2023 2024-11-18 111 sobereva 2024-11-19 08:46
求助RNA+蛋白质+水的较大体系运算如何降低计算时间 分子模拟 (Molecular Modeling) 高小白123 2024-11-18 462 xsc6 7 day ago
不同自选多重度下，中心金属Cr呈现不同的构型，但是两者之间的能量差距相差太大attach_img 量子化学 (Quantum Chemistry) huaying 2024-11-18 118 sobereva 2024-11-19 08:55
求助sobEDA中经典静电相互作用的物理意义attach_img 量子化学 (Quantum Chemistry) yjk 2024-11-18 240 yjk 2024-11-19 09:36
reaxff势函数格式问题求助attachment 分子模拟 (Molecular Modeling) violet123 2024-11-18 00 violet123 2024-11-18 17:56
求助不涉及共价键断裂的过渡态搜寻attach_img 量子化学 (Quantum Chemistry) Kary 2024-11-18 462 wzkchem5 2024-11-19 11:27
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求助各位老师和大佬解答一些Gaussian16中BOMD功能实现准经典动力学时的问题attach_img 量子化学 (Quantum Chemistry) 埋头库库炫饭 2024-11-18 127 sobereva 2024-11-19 08:38
求与ORCA6配套的avogadroattachment  ...2 量子化学 (Quantum Chemistry) popeyezheung 2024-11-18 18336 popeyezheung 7 day ago
求助用CASTEP计算出C的态密度的费米能级位置与文献不符，缺少能量大于0的部分？attach_img 第一性原理 (First Principle) ly123456789 2024-11-18 848 ly123456789 2024-11-19 13:03
苯酚化学性质的可视化表示attach_img 波函数分析与Multiwfn (Wavefunction Analysis & Multiwfn) 是桂桂 2024-11-18 8132 是桂桂 7 day ago
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求助反铁磁结构体系优化结束后发现所有的磁矩都朝一个方向了 第一性原理 (First Principle) 汪杰 2024-11-18 00 汪杰 2024-11-18 15:00
求助CASTEP模块进行磁性矿物结构优化 第一性原理 (First Principle) calcalcal 2024-11-18 424 calcalcal 2024-11-19 21:26
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复介电常数虚部与溶液浓度的关系attach_img 分子模拟 (Molecular Modeling) jlyjlysjd 2024-11-18 138 goldNAN 5 day ago
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求助：想构建48个单体随机聚合，成环，形成网状聚合物长链，不知道从何下手attach_img 分子模拟 (Molecular Modeling) cpa 2024-11-18 243 cpa 2024-11-18 12:21
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跑AIMD时平衡相阶段和产生相阶段的步长是否要一致 分子模拟 (Molecular Modeling) ljh123 2024-11-17 335 sobereva 2024-11-18 13:29
做含磷小分子与其受体蛋白的模拟时去掉了1-4作用项，这种情况下还能分析静电作用么？attach_img 分子模拟 (Molecular Modeling) JAM452 2024-11-17 662 JAM452 7 day ago
跑NVT的时候One or more water molecules can not be settled问题求助attachment 分子模拟 (Molecular Modeling) yixiansheng 2024-11-17 00 yixiansheng 2024-11-17 15:23
请问从pdb下载的结构，使用pdb2gmx产生的拓扑文件会有问题吗？如果会请问如何处理？attach_img 分子模拟 (Molecular Modeling) Nana_suki 2024-11-17 127 sobereva 2024-11-18 10:25
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求助VASP热力学积分计算自由能attach_img 第一性原理 (First Principle) phyang 2024-11-17 00 phyang 2024-11-17 09:56
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